公司连带责任罚款1000元是否合法需分情况讨论，具体分析如下：

1. 若罚款依据为合法有效的公司规章制度
   根据《劳动合同法》第四条，公司通过民主程序制定的规章制度（如员工手册）中明确规定连带责任罚款条款，且内容不违反法律强制性规定（如罚款金额不超过月工资20%、不侵害基本生存权等），则罚款可能合法。但需注意：

   • 罚款需以员工存在过错为前提（如因员工失职导致公司损失）；
     
   • 罚款后员工工资不得低于当地最低工资标准；
     
   • 规章制度需经职工代表大会或全体职工讨论、公示或告知员工。

2. 若罚款依据为劳动合同约定
   若劳动合同中约定“员工需对第三方损失承担连带责任并接受罚款”，该条款可能因违反《劳动合同法》第二十六条“排除劳动者权利”而被认定无效。连带责任通常需法律明确规定（如《民法典》中担保人责任），不能通过合同随意创设。

3. 若罚款缺乏法律依据或程序瑕疵

   • 无制度依据：公司未制定规章制度或制度未公示，直接罚款违法；
     
   • 金额超限：罚款超过月工资20%的部分无效；
     
   • 程序违法：未听取员工陈述申辩、未出具书面处罚决定等，可能构成程序违法。

建议行动：

• 若您是员工，可要求公司出具罚款依据（制度条款、损失证明等），核对是否符合上述合法要件；
  
• 若您是公司，需完善制度合法性审查，确保罚款有据、程序合规，避免劳动争议。
  

如有具体场景或合同条款，可进一步提供细节，我将为您分析合规性。