工伤双方自愿和解协议书签字按指纹，在符合相关法律法规且双方自愿、内容合法的前提下，通常是有效的。以下从多个角度对此进行详细分析：
法律依据与有效性基础
《民法典》的相关规定：
- 根据《民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这表明，指纹与签名、盖章具有同等的法律效力，都是对协议内容的确认方式。在工伤和解协议中，双方签字按指纹即表示对协议内容的认可和接受。
工伤和解协议的特殊性：
- 工伤和解协议是劳动者与用人单位就工伤赔偿等事宜达成的协议。与一般的民事合同不同，它涉及劳动者的切身利益，特别是工伤赔偿等法定权益。因此，在签订工伤和解协议时，必须确保双方自愿、内容合法，且不违反法律法规的强制性规定。
有效性分析要点
双方自愿：
- 工伤和解协议的签订必须基于双方自愿的原则。任何一方不得通过欺诈、胁迫等手段迫使对方签订协议。如果协议是在非自愿的情况下签订的，那么该协议可能因存在可撤销情形而无效。
内容合法：
- 工伤和解协议的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定。例如，协议中约定的赔偿金额不得低于法定标准，否则该条款可能被认定无效。同时，协议也不得损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。
形式合规：
- 工伤和解协议应当采用书面形式，并由双方签字按指纹确认。签字按指纹是确认协议内容的重要方式，也是协议生效的必要条件之一。如果协议形式不合规，如未采用书面形式或未签字按指纹，那么该协议可能无法产生法律效力。
特殊情况下的效力问题
指纹真实性存疑：
- 如果一方对指纹的真实性提出异议，主张指纹被伪造或在非自愿情况下被按，那么需要通过司法鉴定等方式确定指纹的真实性。若指纹被证实为伪造或非自愿，则协议可能因此无效。
存在可撤销情形：
- 如果协议签订过程中存在重大误解、显失公平等可撤销情形，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构撤销协议。例如，用人单位利用劳动者对法律的不了解，设置明显不合理的条款，导致劳动者权益受到重大损害，劳动者可在法定期限内请求撤销该协议。
内容违法：
- 如果协议内容违反法律法规的强制性规定，如约定排除劳动者依法享有的权益、不支付经济补偿金等，则该协议无效，指纹确认亦不具有法律效力。
法律建议
签订前仔细审查协议内容：
- 在签订工伤和解协议前，双方应仔细审查协议内容，确保协议内容合法、公正，且不损害任何一方的合法权益。如有疑问或不确定之处，应及时咨询专业律师。
保留相关证据：
- 在签订协议过程中，双方应保留相关证据，如协商记录、医疗证明、工资单等，以备在协议履行过程中或发生争议时使用。
及时履行协议义务：
- 协议签订后，双方应按照协议约定及时履行各自的义务。如一方未履行义务或履行义务不符合约定，另一方有权要求其承担违约责任。
总结：工伤双方自愿和解协议书签字按指纹在符合相关法律法规且双方自愿、内容合法的前提下是有效的。但双方在签订协议时应谨慎审查协议内容，确保协议合法、公正，并保留相关证据以备不时之需。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。