关于“打卡迟到2分钟是否会扣全勤奖金”的问题，结论并非绝对，需结合具体情况分析。以下是从不同角度给出的详细解答：

1. 公司规章制度的角度：

   • 规章制度内容：首先，要查看公司的具体规章制度或员工手册中关于迟到和全勤奖金的规定。不同公司对此有不同的规定，有的公司可能规定迟到一定时间（如5分钟、10分钟）以上才会扣除全勤奖金，而有的公司则可能规定只要迟到就会扣除。
   • 规章制度合法性：同时，要确认这些规章制度是否经过合法程序制定，并已向员工公示或告知。如果规章制度未经合法程序制定或未向员工公示，那么其规定可能不具有法律效力。

2. 劳动合同的角度：

   • 劳动合同内容：劳动合同是员工与公司之间约定权利和义务的重要文件。如果劳动合同中明确规定了迟到与全勤奖金的关系，那么应按照劳动合同的约定执行。
   • 劳动合同变更：如果劳动合同中没有相关规定，或者规定与规章制度存在冲突，那么应优先适用劳动合同的约定。当然，如果双方协商一致，也可以对劳动合同进行变更。

3. 实际操作的角度：

   • 公司执行情况：即使规章制度或劳动合同中有相关规定，公司在实际操作中也可能存在灵活性。例如，公司可能根据员工的迟到频率、迟到原因等因素来决定是否扣除全勤奖金。
   • 员工申诉机制：如果员工认为公司的扣除全勤奖金行为不合理，可以通过公司内部的申诉机制进行申诉，或者向劳动监察部门投诉。

4. 法律建议：

   • 了解规定：作为员工，应首先了解公司的规章制度和劳动合同中关于迟到和全勤奖金的规定。
   • 保留证据：如果发生迟到情况，应保留好相关证据（如打卡记录、请假条等），以备不时之需。
   • 协商沟通：如果认为公司的扣除全勤奖金行为不合理，可以与公司进行协商沟通，寻求解决方案。
   • 法律途径：如果协商无果，可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。

举例说明：假设某公司的规章制度规定，迟到5分钟以上才会扣除全勤奖金。如果员工只是迟到了2分钟，那么根据这一规定，公司是不应该扣除其全勤奖金的。但如果公司的规章制度或劳动合同中有其他规定，或者公司在实际操作中存在其他考虑因素，那么结果可能会有所不同。

可能后果：如果公司未经合法程序制定规章制度或未向员工公示，却依据该规章制度扣除员工全勤奖金，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司返还被扣除的全勤奖金。

总结与建议：打卡迟到2分钟是否会扣全勤奖金，需结合公司的规章制度、劳动合同以及实际操作情况来综合判断。作为员工，应了解自己的权益和公司的规定，并在必要时采取合适的措施来维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。