毕业协议书盖章与签字的主体问题，需根据协议的具体性质和目的来确定，但通常情况下，毕业协议书会涉及甲方（如学校或用人单位）和乙方（学生）双方，且双方均需在协议上签字或盖章以表示认可。以下是对此问题的详细分析：

1. 协议性质与目的：

   • 毕业协议书可能是学校与学生之间关于毕业相关事宜的约定，也可能是学生与用人单位之间关于就业意向或就业条件的约定。
   • 无论是哪种性质的协议，其目的都是为了明确双方的权利和义务，确保协议的履行。

2. 签字与盖章的法律意义：

   • 签字是表示个人对协议内容的认可和接受，具有个人行为的法律效力。
   • 盖章则是表示单位或组织对协议内容的认可和接受，具有单位行为的法律效力。
   • 在协议中，签字和盖章往往具有同等的法律效力，但具体取决于协议的约定和法律法规的规定。

3. 毕业协议书中的签字与盖章：

   • 如果毕业协议书是学校与学生之间的约定，那么通常学校（甲方）会盖章，学生（乙方）会签字。这是因为学校作为单位，其盖章具有法律效力；而学生作为个人，其签字也具有法律效力。
   • 如果毕业协议书是学生与用人单位之间的约定，那么同样地，用人单位（甲方）会盖章，学生（乙方）会签字。这既符合单位行为的法律要求，也符合个人行为的法律要求。

4. 特殊情况下的处理：

   • 在某些特殊情况下，如协议涉及重要事项或双方有特别约定时，可能会要求双方都盖章或都签字，以增加协议的法律效力和可信度。
   • 另外，如果协议中有明确规定签字或盖章的具体要求，如必须使用公章、合同专用章等，那么双方应严格按照协议规定执行。

建议：

• 在签订毕业协议书前，务必仔细阅读协议内容，了解双方的权利和义务。
• 确认协议中关于签字和盖章的具体要求，并按照要求执行。
• 如有任何疑问或不确定之处，建议咨询专业律师或相关法律机构，以确保协议的合法性和有效性。

法律后果：

• 如果协议中的签字或盖章不符合法律法规的规定或协议的约定，可能会导致协议无效或部分无效。
• 在协议履行过程中，如果因签字或盖章问题引发纠纷，可能会给双方带来不必要的法律风险和经济损失。

因此，在签订毕业协议书时，请务必谨慎对待签字和盖章问题，确保协议的合法性和有效性。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。