工厂在此次事故中一般不承担直接责任，但可能因未依法缴纳社保面临行政处罚，且员工可依法主张工伤保险待遇（若构成工伤）。以下从不同角度展开分析：

一、交通事故责任层面：员工全责，工厂无直接过错

根据《道路交通安全法》及实施条例，交通事故责任划分以行为人过错程度为依据。本案中，员工因“无意识闯红灯”被认定全责，说明其违反交通信号灯的行为是事故发生的直接原因，工厂作为用人单位，对员工下班途中的个人交通行为无法预见、无法控制，不存在过错或违法行为，因此工厂无需对事故本身承担民事赔偿责任。

二、工伤保险责任层面：需判断是否构成工伤

若员工被认定为工伤，工厂虽未缴纳工伤保险，仍需承担工伤保险待遇支付责任。根据《工伤保险条例》第十四条第六项，员工在“上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故伤害”的，应认定为工伤。但本案中员工负全责，不满足“非本人主要责任”条件，原则上不构成工伤。

例外情形：若员工能证明事故系因“无意识状态”（如突发疾病导致失控）引发，且该状态与工作存在关联性（如长期夜班导致健康受损），可能通过“工作相关性疾病”或“视同工伤”条款争取认定，但需结合具体证据和司法实践判断，此类情形认定难度极高。

三、工厂未缴纳社保的行政责任与员工救济途径

工厂未依法为员工缴纳社会保险（含工伤保险），违反《社会保险法》第五十八条、第六十条，员工可向当地社保部门投诉，要求工厂补缴社保。若工厂拒不补缴，社保部门可责令改正、处以罚款，甚至申请法院强制执行。

员工权益保障建议：

1. 要求工厂补缴社保：保留劳动合同、工资记录等证据，向社保部门举报，迫使工厂履行法定义务；
2. 主张民事赔偿：若事故中存在第三方责任（如机动车方），可向第三方索赔；若工厂存在其他过错（如强制加班导致疲劳驾驶），可另行主张侵权责任，但本案中无证据支持；
3. 申请法律援助：若经济困难，可向当地法律援助中心申请免费律师协助处理社保补缴或事故赔偿问题。

四、工厂合规建议

1. 依法缴纳社保：避免行政处罚及工伤待遇支付风险；
2. 加强安全教育：针对夜班员工开展交通安全培训，降低事故风险；
3. 完善考勤制度：避免员工因过度疲劳引发意外，间接减少用工风险。

总结：工厂对事故本身无责，但需承担未缴社保的行政责任；员工可通过补缴社保、民事索赔等途径维护权益。如有进一步疑问，欢迎随时向我咨询。