结论概述：
- 关于追诉期限：若收取“辛苦费”的行为已超过法律规定的追诉期限，则一般不再追究刑事责任，但民事责任和行政责任可能不受追诉期限的限制。
- 可能承担的法律责任：尽管刑事追诉期限已过，但员工仍可能需承担民事赔偿责任（如退还非法所得）及面临行政处罚（如罚款、警告等），具体取决于行为的性质和后果。
详细分析：
一、追诉期限的适用
首先，需要明确的是，追诉期限主要适用于刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪经过一定期限后不再追诉。这一期限的长短取决于犯罪的性质和法定最高刑。然而，对于民事责任和行政责任，通常不存在追诉期限的问题，或者其追诉期限与刑事责任不同。
二、可能承担的法律责任
刑事责任：
- 若收取“辛苦费”的行为构成犯罪（如受贿罪、非国家工作人员受贿罪等），且已超过追诉期限，则一般不再追究刑事责任。但需注意，如果行为人在追诉期限内又犯新罪，或者案件涉及特别重大、复杂等情况，追诉期限可能会延长。
民事责任：
- 无论是否超过刑事追诉期限，员工都可能需要承担民事赔偿责任。如果收取“辛苦费”的行为给公司或其他方造成了损失，员工应当退还非法所得，并可能需赔偿因此造成的其他损失。
行政责任：
- 根据相关法律法规，员工收取“辛苦费”的行为还可能面临行政处罚。例如，如果行为违反了公司规章制度或行业规范，公司或相关监管机构可能对员工进行罚款、警告、解雇等行政处罚。这些行政责任通常不受追诉期限的限制。
三、具体情境下的法律责任
- 如果行为构成犯罪但已过追诉期限：员工虽不再承担刑事责任，但仍需承担民事赔偿责任，并可能面临行政处罚。公司或其他受损方可以通过民事诉讼要求员工退还非法所得并赔偿损失。
- 如果行为不构成犯罪：员工则主要需承担民事赔偿责任和可能的行政处罚。公司可以根据内部规章制度对员工进行处理，如警告、罚款、解雇等，并有权要求员工退还非法所得。
四、建议与行动
- 对于员工：如果意识到自己收取“辛苦费”的行为可能违法或违规，应尽快与公司沟通并退还非法所得，以减轻可能的法律责任。同时，应咨询专业律师以了解自己的法律地位和可能的法律后果。
- 对于公司：如果发现员工有收取“辛苦费”的行为，应及时进行调查并收集证据。根据行为的性质和后果，公司可以决定是否对员工进行内部处理或向相关监管机构报告。同时，公司也有权通过民事诉讼要求员工退还非法所得并赔偿损失。
最后，每个案件的具体情况都有所不同，因此上述分析仅供参考。如果你或你的公司面临类似问题，建议直接向我咨询以获取更具体、更专业的法律建议。