年休假按规定计入工时是否合法，需分情况讨论：
若企业实行综合计算工时工作制，并依法审批备案：
- 在这种情况下，年休假可以计入综合计算工时周期内的总工时。但企业必须确保在综合计算周期内（如一年），员工的总工作时间不超过法定标准（具体根据当地规定执行，一般每年不超过2000小时左右，需结合具体地区和行业规定），并且保障员工的休息休假权利。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，但需保障劳动者身体健康，且每月延长工作时间不得超过三十六小时。同时，劳动者享有休息休假的权利，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。在综合计算工时工作制下，只要总工时不超标且休息休假权利得到保障，年休假计入工时是合法的。
若企业未实行综合计算工时工作制，或未经审批擅自实行：
- 在这种情况下，年休假不应计入日常工时。年休假是劳动者依法享有的休息休假权利，与日常工作时间应分开计算。如果企业将年休假计入工时，可能构成变相延长工作时间，侵犯劳动者的休息休假权利。
- 法律后果：企业可能面临劳动行政部门的处罚，如警告、罚款等。同时，劳动者有权要求企业支付加班费或补休，并可能因此解除劳动合同并要求经济补偿。
法律建议：
- 对于企业而言，如果希望实行综合计算工时工作制并将年休假计入工时，应依法向劳动行政部门申请审批，并确保在综合计算周期内总工时不超标且休息休假权利得到保障。
- 对于劳动者而言，如果发现企业未经审批擅自将年休假计入工时，或虽然经过审批但违反了相关法律法规的规定（如超时加班未支付加班费、未保障休息休假权利等），可以向劳动行政部门投诉或寻求法律援助。
进一步思考：
- 在实际操作中，企业应如何平衡生产经营需要与劳动者休息休假权利的关系？这需要企业根据自身情况制定合理的工时制度，并加强与劳动者的沟通和协商。
- 劳动者在面对企业违法延长工作时间或侵犯休息休假权利的行为时，应如何维护自己的合法权益？这需要劳动者了解相关法律法规，增强法律意识，并在必要时寻求法律援助或提起劳动争议仲裁。
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