结论：在符合当地最低工资标准且整体收入不低于该标准的前提下，学徒工资2000元、补贴房租900元并购买社保是合法的。以下为详细分析：

1. 工资与补贴的合法性
   根据《劳动法》及《最低工资规定》，用人单位支付的工资不得低于当地最低工资标准。若2000元工资加上900元房租补贴后的总和不低于当地最低工资，则合法；若低于，则需补足差额。例如，若当地最低工资为2500元，则2000元工资+900元补贴=2900元，已超过标准，合法；若最低工资为3000元，则需补足100元。

2. 社保缴纳的强制性
   根据《社会保险法》，用人单位必须为劳动者缴纳社保（养老、医疗、失业、工伤、生育保险），费用由单位和个人按比例分担。即使工资较低，社保也必须缴纳，不能以补贴形式替代。若单位未缴纳，劳动者可向劳动监察部门投诉，要求补缴并可能主张经济补偿。

3. 工资结构的合理性
   房租补贴属于福利性收入，通常不计入最低工资计算基数（除非地方规定明确纳入）。但需注意：

   • 补贴是否以“工资”名义发放？若补贴与工资分开列明且合同明确约定，一般不影响合法性；
     
   • 若单位将补贴视为“预支工资”或“借款”，可能涉嫌变相降低工资，需警惕。

4. 特殊情形：学徒身份的适用性
   若学徒属于“非全日制员工”或“实习学生”，可能不适用最低工资标准（需结合地方规定）。但若签订劳动合同、建立劳动关系，则必须按最低工资标准执行。

建议行动：

1. 核对当地最低工资标准，计算工资+补贴总和是否达标；
   
2. 要求单位提供工资条，明确工资、补贴、社保扣款的明细；
   
3. 若单位未缴社保或工资低于标准，可向劳动监察大队举报或申请劳动仲裁。
   

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