二手车发票金额低确实有可能影响法院判决，但具体影响程度需结合案件实际情况综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

1. 发票金额与车辆实际价值的关系
   发票金额是车辆交易时的重要凭证，但法院在判决时不会仅以发票金额作为唯一依据。若发票金额明显低于车辆实际市场价值，且存在合理理由（如卖家急于出手、车辆存在瑕疵等），法院可能结合其他证据（如评估报告、同类车型市场价、交易时的聊天记录等）综合认定车辆实际价值。此时发票金额低可能仅作为参考因素，不影响最终判决。

2. 发票金额与合同效力的关系
   若买卖双方在合同中明确约定了车辆价格，且发票金额与合同金额一致，法院通常会认可合同约定的价格。但若发票金额低于合同金额，且卖家主张以发票金额为准，法院可能要求卖家提供证据证明双方实际履行的是发票金额（如付款记录、补充协议等）。若卖家无法提供充分证据，法院可能仍以合同金额为准判决。

3. 发票金额与税务、违法问题的关联
   若发票金额低是为了逃避税费或存在其他违法行为（如虚开发票、阴阳合同等），法院在判决时可能对违法行为进行否定性评价，并可能将发票金额作为认定交易不真实或违法的依据。此时发票金额低可能对卖家不利，甚至导致合同被认定无效或部分无效。

4. 发票金额与举证责任的关系
   在诉讼中，发票金额低可能影响举证责任的分配。例如，若买家主张车辆实际价值高于发票金额，需提供证据证明；若卖家主张车辆实际价值低于发票金额，同样需提供证据。法院会根据双方举证情况，结合案件事实综合判断。

建议：

• 若你作为卖家，建议保留与交易相关的所有证据（如合同、付款记录、车辆评估报告等），以证明发票金额的合理性。
  
• 若你作为买家，若发现发票金额明显低于车辆实际价值，可要求卖家补充说明或提供其他证据，并在诉讼中积极举证。
  
• 若涉及违法行为（如虚开发票），建议及时纠正并咨询专业律师，避免法律风险。

如有具体案件或细节需要进一步分析，可直接向我咨询。