在行政处罚案件中，若调查无法查实违法事实，通常有以下几种处理方式：

1. 作出不予行政处罚的决定
   根据《行政处罚法》第四十条，行政机关在调查后，若违法事实不能成立的，不得给予行政处罚。这是法律明确规定的“疑案从无”原则，即当证据不足以证明违法行为存在时，行政机关应终止处罚程序，不得主观臆断或推定违法。例如，在环保处罚案件中，若监测数据无法证明企业超标排放，或证据链存在断裂（如无直接目击证人、物证灭失等），行政机关应依法作出不予处罚决定。

2. 补充调查或延长调查期限（需符合法定条件）
   若因客观原因（如关键证据需第三方鉴定、涉案人员拒不配合等）导致调查未完成，行政机关可依据《行政处罚法》第五十六条，在法定期限内补充调查或延长调查期限。但需注意：

   • 延长需以“必要”为前提，且不得违反法定程序（如未告知当事人延长理由）；
     
   • 若补充调查后仍无法查实，仍应回归“不予处罚”结论。
     例如：市场监管部门调查某公司虚假宣传，但关键电子数据被删除，可申请技术恢复并延长调查期，若最终无法恢复，则不得处罚。

3. 移送其他机关处理（若涉嫌犯罪或需其他部门管辖）
   若调查中发现案件可能涉及刑事犯罪（如生产销售伪劣产品罪），或属于其他行政机关管辖范围（如土地违法案件应由自然资源部门处理），行政机关应依据《行政处罚法》第二十七条，将案件移送司法机关或有权部门，并终止本机关的处罚程序。
   例如：税务部门在调查偷税案时发现金额巨大，可能构成逃税罪，应移送公安机关立案侦查。

4. 当事人主动澄清或提供反证
   若当事人在调查过程中提供有效证据（如监控录像、合同、第三方检测报告等）证明自身无违法事实，行政机关应依法采纳并终止调查。当事人享有陈述、申辩权，行政机关不得忽视其提供的反证。
   例如：城管部门调查占道经营，当事人提供场地租赁合同证明合法经营，城管应核实后终止处罚。

实务建议：

• 对行政机关：严格遵循“证据确凿”原则，避免“以罚代管”或“推定违法”，否则可能因程序违法被复议机关或法院撤销处罚决定。
  
• 对当事人：若认为行政机关调查不公，可依法申请听证、提起行政复议或诉讼，要求行政机关举证证明违法事实存在。
  

如有具体案件细节（如行业、证据类型等），可进一步向我咨询，我会结合案例为您分析风险点。