若行政违法类案件立案后，经调查违法事实不成立，行政机关应当依法作出撤销案件或不予处罚的决定。具体分析如下：
撤销案件：在行政违法案件立案后，行政机关会进行一系列的调查活动，以收集证据、查明事实。如果经过全面、客观的调查，发现违法事实并不存在，或者证据不足以证明违法事实成立，那么行政机关应当依法撤销该案件。撤销案件意味着行政机关不再对该案件进行进一步的调查或处理，案件到此为止。
不予处罚：在某些情况下，虽然违法事实可能存在，但经过调查发现，该行为并不构成行政处罚的条件，或者存在法定不予处罚的情形（如违法行为轻微并及时纠正，没有造成危害后果等）。在这种情况下，行政机关应当作出不予处罚的决定，并告知当事人不予处罚的理由和依据。
在处理此类案件时，行政机关还需注意以下几点：
程序合法性：行政机关在撤销案件或作出不予处罚决定时，必须严格遵守法定程序，确保当事人的合法权益不受侵害。这包括告知当事人有权陈述、申辩，以及在必要时举行听证等。
证据充分性：行政机关在作出决定前，必须确保所收集的证据充分、确凿，能够支持其决定。如果证据不足或存在疑问，行政机关应当继续调查或寻求其他证据，而不是轻易作出撤销案件或不予处罚的决定。
决定文书制作：行政机关应当制作正式的决定文书，明确载明撤销案件或不予处罚的理由、依据和结果，并送达当事人。这有助于保障当事人的知情权，也有助于后续的法律监督和救济。
若当事人对行政机关的决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。在处理此类法律问题时，如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。