结论前置：公司扣留员工的健康证是不合理的，员工有权要求公司归还。若公司拒绝，员工可通过一系列法律途径维护自身权益，并在必要时重新办理健康证。
一、公司无权扣留员工健康证的法律分析
健康证的性质：健康证是员工的个人证件，用于证明其身体健康状况符合从事特定工作的要求。它属于员工的个人财产，公司无权扣留或占有。
法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，公司应当尊重员工的合法权益，包括个人证件的保管和使用。公司扣留员工健康证的行为，可能构成对员工合法权益的侵犯。
二、员工应对公司扣留健康证的措施
与公司沟通协商：
- 友好沟通：员工可以首先尝试与上级或人力资源部门进行平和的交流，说明健康证的重要性及个人需求，询问扣留原因，并寻求解决方案。
- 书面催告：若口头沟通无果，员工可以发送电子邮件或书面函件，正式要求公司归还健康证，并限定合理的归还期限。
收集证据：在沟通过程中，员工应保留与公司沟通的记录、健康证的复印件等证据，以备后续使用。
外部协助：
- 向劳动监察部门投诉：员工可以准备相关材料（如身份证、劳动关系证明、健康证信息等），向当地劳动监察部门投诉，请求介入处理。
- 向工会组织反映：如果员工所在单位有工会组织，也可以向工会反映情况，寻求帮助和支持。
- 申请劳动仲裁：若上述途径均未能解决问题，员工可以根据《劳动争议调解仲裁法》向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。提起劳动仲裁的一方应在劳动争议发生之日起一年内提出书面申请。
三、重新办理健康证的流程与要求
若员工无法从公司拿回健康证且急需使用，可以选择重新办理：
了解办理地点和要求：
- 员工可以通过当地卫生健康委员会的官方网站、电话咨询等方式，了解具体的办理地点、时间及所需材料。
- 通常需要准备身份证原件及复印件、个人免冠一寸照片（一般为1-2张），部分地方可能还要求提供用人单位证明或营业执照副本复印件等材料。
进行健康检查：
- 员工需要前往指定地点进行健康检查，项目通常包括体格检查、肝功能、血常规、尿常规、粪便检查、胸透等。
- 检查时要如实告知医生健康状况，按指示完成各项检查。费用因地区和项目而异，一般在几十元到几百元不等。
领取健康证：
- 完成检查后，员工需要等待检测和审核。若检查结果合格，在规定时间内（一般为几个工作日到一周左右）凭缴费凭证、身份证等材料领取新证。部分地方提供邮寄服务，员工可以咨询选择。
四、注意事项
- 具体流程与材料：因地区和行业差异，办理流程和所需材料可能有所不同。员工在办理前应提前咨询当地卫生部门或相关机构以获取准确信息。
- 法律意识：员工应增强法律意识，了解自己的合法权益，并在必要时采取法律手段维护自身权益。
作为董飞律师，我建议员工在遇到公司扣留健康证的情况时，首先保持冷静，通过合法途径维护自己的权益。如果还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。