事业单位未休假补助的计算是否包括补充绩效奖，需根据具体情况和地方规定来判断，但通常情况下，未休假补助的计算基数并不直接包含补充绩效奖。以下是对此问题的详细分析：
一、未休假补助的基本规定
根据《职工带薪年休假条例》及相关规定，职工在未享受年休假的情况下，有权获得相应的未休假补助。这一补助的计算通常基于职工的日工资收入，并按照一定比例进行支付。日工资收入的计算，一般是指职工在用人单位支付其未休年休假工资报酬前12个月剔除加班工资后的月平均工资。
二、补充绩效奖的性质
补充绩效奖是事业单位根据职工的工作表现、业绩等因素发放的一种奖励性工资。它不属于基本工资的范畴，而是对职工工作成果的一种额外认可。因此，在计算未休假补助时，补充绩效奖是否纳入计算基数，需要看具体的地方规定或单位政策。
三、地方规定与单位政策的差异
地方规定：不同地区对于事业单位未休假补助的计算可能有不同的规定。有些地区可能明确规定未休假补助的计算基数包括基本工资和某些特定的津贴、补贴，但不一定包括补充绩效奖。而有些地区则可能对此没有明确规定，或者规定得相对模糊。
单位政策：除了地方规定外，事业单位本身也可能制定相关的政策来明确未休假补助的计算方式。这些政策可能根据单位的实际情况、财务状况以及职工的需求等因素进行制定。因此，即使地方规定没有明确提及补充绩效奖是否纳入计算基数，单位政策也可能对此有所规定。
四、实际操作中的建议
查阅地方规定：首先，建议查阅所在地区关于事业单位未休假补助的具体规定，以了解计算基数是否包括补充绩效奖。
咨询单位人事部门：如果地方规定没有明确提及或规定得相对模糊，建议咨询所在单位的人事部门或相关负责人，以了解单位的具体政策。
保留相关证据：在申请未休假补助时，建议保留好相关的证据材料，如工资条、考勤记录等，以便在需要时进行证明。
总结来说，事业单位未休假补助的计算是否包括补充绩效奖并没有一个统一的答案，而是需要根据具体情况和地方规定来判断。如果对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。