结论：在同一单位子公司连续签两次无固定期限合同后，第三次签订三年固定期限劳动合同，在一般情况下是合法的，但需满足特定条件，即劳动者未提出订立无固定期限劳动合同，且不存在法律规定的应当订立无固定期限劳动合同的其他情形。以下从不同角度进行分析：
法律背景与规定
固定期限劳动合同的定义与签订：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第十三条，固定期限劳动合同是指用人单位与劳动者约定合同终止时间的劳动合同。双方协商一致，可以订立固定期限劳动合同。
- 劳动合同签订的期限由用人单位和劳动者双方协商确定，法律并未强制规定必须签订无固定期限劳动合同或限制固定期限劳动合同的签订次数（《劳动合同法》第十六条）。
无固定期限劳动合同的签订条件：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第十四条，当劳动者已连续订立二次固定期限劳动合同，且没有第三十九条和第四十条第一项、第二项规定的情形（即严重违反用人单位规章制度、因健康或能力问题不能胜任工作等）时，续订劳动合同时，除劳动者提出订立固定期限劳动合同外，应当订立无固定期限劳动合同。
合法性分析
一般情况下的合法性：
- 在一般情况下，用人单位与劳动者连续签订三次固定期限劳动合同是合法的，只要双方在平等自愿、协商一致的基础上签订合同，且内容不违反法律法规的强制性规定。
- 在您描述的情况下，如果劳动者在第三次签订合同时未提出订立无固定期限劳动合同，且不存在法律规定的应当订立无固定期限劳动合同的其他情形，那么签订三年固定期限劳动合同是合法的。
特定情形下的不合法性：
- 如果劳动者在第三次签订合同时提出订立无固定期限劳动合同，且符合《劳动合同法》第十四条规定的条件（即已连续订立二次固定期限劳动合同，且没有第三十九条和第四十条第一项、第二项规定的情形），那么用人单位应当与劳动者订立无固定期限劳动合同。
- 如果用人单位在这种情况下仍然与劳动者签订三年固定期限劳动合同，则可能构成违法，劳动者有权要求用人单位改正或通过法律途径维护自身合法权益。
实际操作建议与权益保护
保留合同证据：
- 作为劳动者，应妥善保管每次签订的劳动合同文本，以便在需要时作为证据使用。
了解自身权益：
- 劳动者应充分了解自己的权益，特别是在符合法定条件下有权要求签订无固定期限劳动合同的权利。
- 若公司未依法与劳动者签订无固定期限劳动合同，劳动者有权要求公司改正；若公司拒绝，劳动者可通过劳动仲裁等法律途径维护自身合法权益。
与用人单位沟通：
- 对于劳动合同的签订或续签有任何疑问或不满，劳动者应与用人单位进行积极沟通，寻求双方都能接受的解决方案。
总结：在同一单位子公司连续签两次无固定期限合同后，第三次签订三年固定期限劳动合同的合法性取决于劳动者是否提出订立无固定期限劳动合同以及是否存在法律规定的应当订立无固定期限劳动合同的其他情形。劳动者应了解自己的权益并保留好相关证据，以便在必要时维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。