结论：三年工期的工程扣工人工资百分之30的钱三年后发，这种做法通常是不合理的，且可能违反相关法律法规。下面从多个角度进行分析：

一、从工资支付的角度

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，雇主应当按时足额支付劳动者的工资，而不能随意扣留或延迟支付。因此，扣留工人工资的30%并在三年后发放，显然违反了工资应当按月支付的规定。

二、从劳动合同的角度

如果雇主与工人之间签订了劳动合同，并且合同中明确规定了工资的支付方式和时间，那么雇主应当按照合同约定履行支付义务。如果合同中没有明确规定扣留工资并在三年后发放的条款，或者该条款违反了法律法规的强制性规定，那么该条款是无效的。雇主不能依据无效的合同条款来扣留工人的工资。

三、从劳动者权益保护的角度

劳动者有权获得按时足额的工资报酬，这是劳动者的基本权益之一。如果雇主扣留工人的工资，不仅损害了劳动者的经济利益，还可能影响劳动者的生活质量和家庭稳定。因此，从保护劳动者权益的角度出发，扣留工资并在三年后发放的做法也是不合理的。

四、可能的法律后果

如果雇主坚持扣留工人的工资并在三年后发放，工人可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求雇主支付被扣留的工资及可能的赔偿金。在极端情况下，如果雇主的违法行为构成犯罪，还可能面临刑事处罚。

建议

1. 与雇主协商：工人可以首先尝试与雇主进行协商，明确表达自己的诉求和权益，要求雇主按时足额支付工资。
2. 寻求法律援助：如果协商无果，工人可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权益和可行的法律途径。
3. 投诉或申请劳动仲裁：在必要时，工人可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

综上所述，三年工期的工程扣工人工资百分之30的钱三年后发是不合理的，且可能违反相关法律法规。工人应当了解自己的权益和可行的法律途径，积极维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。