工厂一个月仅休息两天的工作安排，在大多数情况下是不合法的，但具体是否合法还需根据工时制度及实际情况来判断。以下是从不同角度的详细分析：
一、标准工时制下的合法性分析
工时制度规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。同时，《国务院关于职工工作时间的规定》第三条进一步明确，职工每日工作8小时，每周工作40小时。
休息日保障：
- 依据《劳动法》第三十八条，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。若一个月仅休息两天，则多数周都无法保证劳动者至少有一天的休息时间，这种情况显然违反了法律规定，是不合法的。
加班限制：
- 虽然《劳动法》允许在一定条件下延长工作时间，但有严格限制，即一般每日不得超过一小时，特殊情况下每日不得超过三小时，且每月不得超过三十六小时。一个月休息两天的安排很可能导致超时工作，违反这一规定。
二、特殊工时制下的合法性分析
不定时工作制：
- 这是一种针对特定生产特点或工作职责而采用的工时制度，不受标准工作时间衡量限制。但即便如此，用人单位仍需采用弹性工作时间等方式确保职工的休息休假权利。在符合规定且经过劳动行政部门审批的情况下，一个月休息两天有可能不违法，但前提是必须保障员工的基本休息权益，如确保员工有足够的连续休息时间，避免长时间连续工作。
综合计算工时工作制：
- 这种工时制度以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。在经批准且符合规定的前提下，一个月休息两天也有可能不违法，但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间，且应确保员工有足够的休息时间。
三、实践建议与法律后果
劳动者应了解自己的权益：
- 劳动者应了解自己的工时制度和相关权益，如认为工作安排侵犯了自己的合法权益，首先应与用人单位协商，要求合理安排工作时间和休息休假。
协商不成时的维权途径：
- 协商不成时，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处，劳动仲裁机构则可以对纠纷进行裁决。
用人单位的法律责任：
- 如果用人单位违反法律规定，安排劳动者长时间工作且不保证足够的休息时间，将可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。同时，劳动者也有权要求用人单位支付加班工资或赔偿损失。
总结来说，工厂一个月仅休息两天的工作安排在大多数情况下是不合法的，特别是在标准工时制下。但在不定时工作制和综合计算工时工作制下，若符合相关规定并经过审批，有可能存在合法的情况。无论如何，劳动者和用人单位都应了解并遵守相关法律法规，以确保双方权益得到妥善保护。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。