工程结算后，在特定条件下是可以做司法鉴定的。这主要取决于工程结算的具体情况以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：
一、可以申请司法鉴定的情形
结算协议存在法定可撤销或无效情形：
- 如果工程结算过程中存在欺诈、胁迫、恶意串通、以合法形式掩盖非法目的、损害社会公共利益或违反法律法规强制性规定等情形，导致结算协议无效或可撤销，那么当事人有权向法院或仲裁机构申请撤销或确认协议无效，并随后申请造价鉴定以确定工程的真实造价。例如，施工方在受威胁下签订了明显低于成本价的结算协议，此时就可以申请撤销并通过造价鉴定重新确定价款。
结算协议未涵盖全部工程内容：
- 因工程变更未及时纳入结算、漏项等原因，导致结算协议未能覆盖全部工程内容时，对于未结算部分，当事人可以申请造价鉴定。比如，施工过程中发包方提出了额外的装修变更要求，但这一变更并未在结算中体现，那么双方就可以就该变更部分申请造价鉴定。
结算依据不明确或存在争议：
- 当结算协议中的计价标准、计量方法等约定不明确，且双方无法协商一致时，可以通过造价鉴定来确定合理的工程价款。例如，结算协议仅约定按市场价格结算，但未明确市场价格确定方式，双方在结算时对价格产生了争议，此时就可以进行造价鉴定。
二、可能不被允许申请司法鉴定的情形
结算协议合法有效且无争议事项：
- 如果工程结算协议是双方真实意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形，内容合法且双方对结果无异议，那么一般不允许再申请造价鉴定。因为此时协议具有合同法律效力，双方应依约履行。
超过申请鉴定的合理期限：
- 在诉讼或仲裁程序中，法院或仲裁机构通常会设定申请鉴定的期限。如果当事人未在期限内提出造价鉴定申请，可能会被视为放弃权利，导致其申请不被准许。
三、申请司法鉴定的注意事项
- 提供完整资料：申请造价鉴定时，需要提供包括合同、图纸、变更记录等在内的完整工程资料，以便鉴定机构全面了解工程情况。
- 协商选择鉴定机构：应与对方协商并达成一致意见，共同选择合适的鉴定机构进行鉴定。如果协商不成，可以由法院或仲裁机构指定。
- 遵循法律程序：在申请造价鉴定过程中，需要遵循相关的法律程序和要求，如预交鉴定费用、在指定期间内提出申请等。
四、法律依据
- 《中华人民共和国民事诉讼法》第七十九条：当事人可以就查明事实的专门性问题向人民法院申请鉴定。这为工程结算后申请造价鉴定提供了法律基础。
- 《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第三十二条：对于工程造价等专门性问题，若当事人有争议且法院认为需要鉴定，应向负有举证责任的当事人释明。但需注意，若当事人在诉讼前已达成结算协议，诉讼中再申请鉴定的，人民法院将不予准许，除非结算协议无效或可撤销。
综上所述，工程结算后能否申请造价鉴定需根据具体情况判断。在满足一定条件的情况下，造价鉴定可以作为解决工程造价争议的有效手段。如果你在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。