结论：合同实际执行金额与签订金额差距较大时，在符合一定条件下可以申请退还印花税差额部分，但具体能否退还以及退还的流程和所需材料，需根据当地税务机关的具体规定和操作流程来确定。
分析说明：
印花税的基本规定：
- 印花税是对经济活动和经济交往中书立、领受具有法律效力的凭证（如合同、产权转移书据、营业账簿、权利许可证照等）所征收的一种税。
- 合同的印花税通常是根据合同金额来计算的，即合同签订时确定的金额。
合同金额变更与印花税的关系：
- 如果合同在实际执行过程中，由于各种原因（如市场变化、双方协商等）导致实际执行金额与签订金额存在较大差距，这并不意味着印花税可以自动调整或退还。
- 印花税的缴纳是基于合同签订时的金额，一旦合同签订并缴纳了印花税，原则上不会因为合同金额的变更而自动调整。
申请退还印花税差额的条件：
- 税务机关认可的情况：某些地区或特定情况下，税务机关可能允许在合同金额发生重大变更时，申请退还部分印花税。但这通常需要满足一定的条件，如合同变更的原因、变更的幅度、是否及时向税务机关申报等。
- 具体规定：由于印花税的具体规定可能因地区而异，因此能否申请退还以及退还的具体条件，需要参考当地税务机关的相关规定和操作流程。
申请退还印花税差额的流程：
- 准备材料：通常需要提供合同原件、变更协议（如有）、印花税缴纳凭证、申请退还印花税的书面申请等。
- 提交申请：将准备好的材料提交给当地税务机关，并按照税务机关的要求填写相关表格。
- 审核与退还：税务机关会对申请材料进行审核，如果符合退还条件，会按照规定的流程退还印花税差额部分。
行动建议：
- 如果您遇到了合同实际执行金额与签订金额差距较大，且希望申请退还印花税差额部分的情况，建议您首先咨询当地税务机关，了解具体的退还条件和流程。
- 同时，保留好所有相关的合同文件、变更协议和印花税缴纳凭证，以便在申请退还时提供必要的证明材料。
注意事项：
- 由于印花税的具体规定可能因地区而异，因此在申请退还前务必了解清楚当地税务机关的相关规定。
- 如果合同金额变更是由于一方违约或违法行为导致的，可能无法申请退还印花税差额部分，甚至可能面临其他法律责任。