在会计支取工程款后给了书记，而书记不承认且没有证据的情况下，责任大小难以直接判定，需根据具体情况分析，但通常会计和书记都可能承担一定责任。以下是从不同角度进行的分析：
一、会计的责任
资金流转的记录与证明：
- 会计作为资金流转的记录者，有责任确保每一笔资金的支出都有明确的记录和相应的凭证。如果会计无法提供支取工程款并交给书记的证据（如转账记录、收条、签字确认等），那么会计在资金流转的记录上存在疏忽或过失。
内部财务管理的规范：
- 会计应遵守公司或组织的内部财务管理规定，确保资金的安全和合规使用。如果会计未经适当授权或违反规定将工程款支取并交给书记，那么会计可能违反了内部财务管理制度，需要承担相应的责任。
二、书记的责任
接收资金的确认与证明：
- 如果书记确实接收了会计支取的工程款，那么书记有责任提供接收资金的确认或证明。如果书记无法提供任何证据证明其接收了资金，或者否认接收了资金，而会计又无法提供相反证据，那么书记可能面临被怀疑侵占或挪用资金的风险。
职务行为的合规性：
- 书记作为组织中的一员，其职务行为应符合组织的规定和法律法规的要求。如果书记利用职务之便侵占或挪用资金，那么书记不仅需要承担民事责任，还可能面临刑事责任的追究。
三、证据缺失下的责任判定
举证责任：
- 在民事诉讼中，通常遵循“谁主张，谁举证”的原则。如果会计主张其已将工程款支取并交给书记，那么会计需要提供相应的证据来支持其主张。如果会计无法提供证据，而书记又否认接收了资金，那么会计可能面临举证不能的风险。
责任分配：
- 在证据缺失的情况下，责任的大小难以直接判定。法院或仲裁机构可能会根据双方的行为、陈述、证据情况以及相关法律法规的规定，综合判断双方的责任大小。如果会计和书记都无法提供充分证据证明自己的主张，那么双方可能都需要承担一定的责任。
四、建议与措施
收集证据：
- 会计应尽快收集与支取工程款并交给书记相关的所有证据，包括转账记录、收条、签字确认等。这些证据将有助于证明会计的主张，并减轻其可能承担的责任。
内部调查：
- 组织或公司可以启动内部调查程序，对会计和书记的行为进行调查。通过调查，可以了解资金流转的真实情况，并确定双方的责任大小。
法律途径：
- 如果双方无法协商解决争议，可以考虑通过法律途径解决。会计可以向法院提起诉讼，要求书记返还资金或承担其他责任。在诉讼过程中，双方需要提供证据支持自己的主张，并接受法院的判决。
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