结论：上班途中发生交通事故，对方车主赔偿了误工费后，公司是否还需支付工伤误工费，这主要取决于具体情况，一般情况下，工伤误工费与交通事故中的误工费赔偿并不冲突，员工有权同时获得这两部分的赔偿。以下从不同角度进行分析：
一、法律原则与规定
工伤保险与交通事故赔偿的独立性：
- 工伤保险是社会保险制度的一部分，旨在保障员工在工作中或因工作原因受到伤害时能够获得医疗救治和经济补偿。
- 交通事故赔偿则是基于侵权责任法，由侵权方（如对方车主）对受害方（如员工）因交通事故造成的损失进行赔偿。
- 这两者是独立的法律关系，员工因交通事故受伤，既可能构成工伤，也可能同时获得交通事故的赔偿。
误工费的双重赔偿：
- 误工费是员工因受伤无法工作而减少的收入损失。
- 在工伤保险中，误工费通常以工伤津贴的形式支付，用于补偿员工因工伤导致的收入减少。
- 在交通事故赔偿中，误工费也是赔偿项目之一，用于补偿员工因交通事故导致的收入减少。
- 员工有权同时获得这两部分的误工费赔偿，因为这两部分赔偿是基于不同的法律关系和事实依据。
二、实际情况与操作
工伤保险的申报与认定：
- 员工在上班途中发生交通事故后，应及时向公司报告，并按照公司的要求申报工伤。
- 公司应协助员工完成工伤认定程序，确保员工能够享受工伤保险待遇。
交通事故赔偿的协商与诉讼：
- 员工应与对方车主或其保险公司协商交通事故赔偿事宜。
- 如果协商不成，员工可以通过法律途径（如诉讼）来维护自己的权益。
避免重复赔偿：
- 虽然员工有权同时获得工伤保险和交通事故赔偿中的误工费，但在实际操作中，应避免重复计算或重复领取。
- 例如，如果员工已经从对方车主或其保险公司那里获得了误工费赔偿，那么在申报工伤保险时，应如实告知这一情况，避免重复领取工伤津贴。
三、特殊情况与注意事项
第三方责任与工伤保险的衔接：
- 如果交通事故是由第三方（如对方车主）造成的，且该第三方已经承担了赔偿责任，那么工伤保险基金在支付相关费用时，可能会考虑第三方的赔偿情况，但通常不会完全免除工伤保险的责任。
地方性法规与政策：
- 不同地区可能有关于工伤保险与交通事故赔偿衔接的具体规定或政策。
- 员工在处理此类问题时，应了解并遵守当地的相关规定和政策。
建议：如果你在上班途中发生了交通事故，并且对方车主已经赔偿了误工费，你仍然有权向公司申报工伤并享受工伤保险待遇，包括工伤津贴（即误工费的一部分）。但为了避免重复赔偿和不必要的麻烦，建议你及时与公司沟通，并如实告知交通事故赔偿的情况。如果你在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。