面对公司否认与员工存在劳动关系，而诉称是合作关系的情况，员工可以采取以下策略来应对：

1. 收集并整理证据：

   • 劳动合同或书面协议：尽管公司可能否认劳动关系，但如果存在书面劳动合同或任何形式的书面协议，这将是证明劳动关系存在的最直接证据。
   • 工资支付记录：包括银行转账记录、工资条等，这些能证明公司定期向员工支付工资，是劳动关系的重要特征。
   • 工作证、工作服、考勤记录：这些物品和记录能证明员工在公司的工作身份和工作时间，有助于证明劳动关系的存在。
   • 同事证言：如果可能，获取同事的证言，他们可以证明员工在公司的工作情况和与公司的关系。
   • 其他相关证据：如公司内部的邮件、短信、微信聊天记录等，只要与工作相关，都可能成为证明劳动关系的证据。

2. 申请劳动仲裁：

   • 在收集到足够证据后，员工可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求确认与公司之间存在劳动关系。
   • 劳动仲裁委员会将根据双方提供的证据和法律规定，对是否存在劳动关系进行裁决。

3. 准备应对公司反驳：

   • 公司可能会提出各种理由来否认劳动关系，如双方是合作关系、员工是独立承包商等。员工需要针对这些反驳准备相应的证据和论点。
   • 例如，如果公司声称是合作关系，员工可以指出合作关系的特征（如共同投资、共享利润、共担风险等）与实际情况不符，而更符合劳动关系的特征（如公司支付工资、提供工作条件、进行管理等）。

4. 了解并引用相关法律法规：

   • 员工应了解《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规中关于劳动关系的定义和认定标准。
   • 在仲裁或诉讼过程中，员工可以引用这些法律法规来支持自己的主张，证明与公司之间存在劳动关系。

5. 寻求专业法律帮助：

   • 如果员工对法律程序或证据收集感到困惑或不确定，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、协助收集证据、代表员工参加仲裁或诉讼等。

可能面临的法律后果：

• 如果劳动仲裁委员会或法院最终认定员工与公司之间存在劳动关系，公司可能需要承担相应的法律责任，如支付未签订劳动合同的双倍工资、补缴社会保险费、支付经济补偿金等。
• 如果公司仍然否认劳动关系并拒绝履行相关义务，员工可以进一步向法院提起诉讼，要求公司承担法律责任。

建议：

• 在整个过程中，员工应保持冷静和理性，避免与公司发生不必要的冲突或争执。
• 员工应积极配合劳动仲裁委员会或法院的工作，提供真实、完整的证据和信息。
• 如有需要，员工应及时向专业律师咨询并寻求法律帮助。

面对公司否认劳动关系的情况，员工应通过收集证据、申请劳动仲裁、准备应对反驳、了解并引用相关法律法规以及寻求专业法律帮助等策略来维护自己的合法权益。