当公司否认劳动关系时，劳动者并非无计可施，可以通过以下途径来维护自己的合法权益：

一、全面收集证据，构建坚实基础

劳动者应尽可能全面地收集能证明劳动关系的证据材料，这是后续维权的关键。具体包括但不限于以下几类：

1. 劳动合同：这是最直接且有力的证据，若已签订，务必妥善保管。它明确规定了双方的权利和义务，是证明劳动关系存在的核心文件。
2. 工资支付凭证或记录：如银行工资流水明细、工资条等，这些记录显示了公司定期向劳动者支付工资的情况，是劳动关系存在的重要证明。
3. 工作证、服务证等证件：带有公司名称、劳动者照片、职务等信息的工作身份证明，能够直观地展示劳动者与公司的关联。
4. 考勤记录：打卡记录、指纹考勤记录等，这些记录证明了劳动者在公司的出勤情况，反映了劳动者接受公司的管理和约束。
5. 社保缴纳记录：社保部门出具的社保缴纳明细，显示了公司为劳动者缴纳社会保险的情况，是证明劳动关系的重要依据。
6. 其他劳动者的证言：同事的证人证言，最好能有出庭作证以增强证明力。同事作为共同工作的伙伴，他们的证言能够从侧面证明劳动关系的存在。
7. 工作相关文件：公司内部的工作安排文件、任务分配邮件、业务合同等，这些文件体现了劳动者参与工作的内容，进一步证明了劳动关系的实际存在。

二、依法申请劳动仲裁，寻求权威裁决

在收集到足够证据后，劳动者可以向当地有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，具体步骤如下：

1. 准备仲裁申请材料：撰写劳动仲裁申请书，明确申请人和被申请人的基本信息，详细阐述仲裁请求、事实和理由，并附上相关证据材料。仲裁申请书是劳动者向仲裁委员会表达诉求的重要文件，需要认真撰写，确保内容清晰、准确。
2. 提交仲裁申请：将仲裁申请书及证据材料一式多份提交至劳动争议仲裁委员会。提交时，要注意按照仲裁委员会的要求进行，确保材料的完整性和规范性。
3. 参加仲裁庭审：在庭审过程中充分陈述事实、展示证据，并对公司主张进行答辩。庭审是仲裁委员会了解案件情况、作出裁决的重要环节，劳动者需要积极参与，充分表达自己的诉求和理由。

三、考虑提起诉讼，维护最终权益

如果劳动者对劳动仲裁裁决结果不满意，或者公司对仲裁结果不服向法院起诉，案件将进入诉讼程序。在法院审理过程中，双方可以进一步提交证据、进行辩论。法院会依据更严格的证据规则和法律规定，对劳动关系是否存在作出最终的判决。提起诉讼是劳动者维护自己权益的最后一道防线，需要认真对待，确保自己的诉求得到充分表达。

四、其他维权途径，灵活应对

除上述途径外，劳动者还可以选择以下方式维权：

1. 向调解组织申请调解：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动者可以向调解组织申请调解，以寻求更为和谐的解决方案。调解组织作为中立的第三方，能够帮助双方沟通协商，达成和解协议。
2. 向劳动行政部门投诉：劳动者也可以向劳动行政部门投诉公司的违法行为，由行政部门进行调查和处理。劳动行政部门具有行政执法权，能够对公司的违法行为进行查处，保护劳动者的合法权益。

五、关键策略与注意事项

1. 确保证据真实性、关联性：在收集证据时，要确保证据的真实性和关联性，避免提供虚假或无关的证据，以免影响仲裁或诉讼的结果。
2. 保留沟通记录备查：在与公司协商沟通时，要以书面形式正式提出诉求，并保留沟通记录备查。这些记录能够作为后续维权的证据，证明劳动者已经积极采取措施维护自己的权益。
3. 注意时效问题：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动仲裁的时效为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者在维权过程中务必注意时效问题，及时采取行动以维护自己的合法权益。

综上所述，当公司否认劳动关系时，劳动者应通过收集证据、依法申请劳动仲裁、提起诉讼以及寻求其他维权途径等来维护自己的合法权益。在整个过程中，劳动者要保持冷静理性，积极应对，确保自己的权益得到充分保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。