结论：公司在员工待岗期间以旷工解除劳动关系是否合法，需根据具体情况判断，包括待岗的合法性、旷工认定的合理性以及解除程序的合法性等多个方面。以下从不同角度进行详细分析：
一、待岗的合法性
合法待岗情形：
- 若公司因生产经营困难、停工停产等原因，依法安排员工待岗，并支付了待岗期间的基本生活费或最低工资标准的工资，且待岗期限符合法律法规或劳动合同的约定，则待岗行为本身是合法的。
- 在此情况下，若员工未经公司同意擅自离岗，公司有权依据规章制度以旷工为由解除劳动关系，但前提是规章制度必须合法有效，且已向员工公示或告知。
非法待岗情形：
- 若公司无正当理由，擅自安排员工待岗，且未支付任何工资或生活费，或支付的工资低于法律法规规定的最低标准，则待岗行为可能构成违法。
- 在此情况下，员工有权拒绝待岗，并要求公司恢复工作或支付相应的工资。若公司以旷工为由解除劳动关系，则可能构成违法解除。
二、旷工认定的合理性
旷工的定义：
- 旷工通常指员工未经公司同意，擅自离岗或未按时到岗的行为。
旷工认定的关键要素：
- 离岗事实：公司需证明员工确实存在离岗或未按时到岗的事实。
- 未经同意：公司需证明员工离岗或未按时到岗未经公司同意或未按照公司规定的程序请假。
- 规章制度依据：公司需依据合法有效的规章制度来认定旷工行为，并确保该规章制度已向员工公示或告知。
待岗期间的旷工认定：
- 在待岗期间，若公司明确要求员工在特定时间或地点待命，而员工未经同意擅自离岗，则可能构成旷工。
- 但若公司未明确待岗期间的具体要求，或员工离岗行为并未影响公司的正常生产经营，则公司以旷工为由解除劳动关系可能缺乏合理性。
三、解除程序的合法性
解除程序的法定要求：
- 根据《劳动合同法》等相关法律法规，公司解除劳动关系需遵循法定程序，包括提前通知、听取员工意见、出具解除证明等。
待岗期间解除劳动关系的程序要求：
- 在待岗期间，若公司以旷工为由解除劳动关系，需确保旷工事实的认定合法合理，且已按照法定程序通知员工并听取其意见。
- 若公司未履行法定程序，或解除决定缺乏事实依据和法律依据，则可能构成违法解除。
四、法律建议
对于公司：
- 在安排员工待岗前，应确保待岗的合法性和合理性，并依法支付待岗期间的工资或生活费。
- 在认定旷工行为时，应确保事实清楚、证据充分，并依据合法有效的规章制度进行。
- 在解除劳动关系时，应遵循法定程序，确保解除决定的合法性和合理性。
对于员工：
- 若公司安排待岗，应了解待岗的合法性和合理性，并要求公司支付相应的工资或生活费。
- 若公司以旷工为由解除劳动关系，应核实旷工事实的认定是否合法合理，并检查公司是否履行了法定程序。
- 若认为公司的解除决定违法，可依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
总结：公司在员工待岗期间以旷工解除劳动关系是否合法，需根据待岗的合法性、旷工认定的合理性以及解除程序的合法性等多个方面进行综合判断。若公司行为存在违法之处，员工有权依法维护自己的合法权益。如有具体法律问题，可直接向我咨询。