关于您提到的1992年建厂批复文件与1996年办理的土地使用证是否合法的问题，这主要取决于几个关键因素，以下是我从不同角度为您进行的分析：

1. 批复文件与土地使用证的关系：

   • 建厂批复文件通常是政府或相关部门对建设项目的初步批准，它表明了政府对建设项目的认可和支持，但并不直接等同于土地使用权的授予。
   • 土地使用证则是确认土地使用权归属的法律文件，它证明了使用者对特定土地拥有合法的使用权。
   • 因此，仅凭建厂批复文件并不能直接证明土地使用证的合法性。土地使用证的合法性需要依据其办理程序、土地来源、土地用途等是否符合相关法律法规来判定。

2. 土地使用证的办理程序：

   • 土地使用证的办理通常需要遵循一系列严格的程序，包括土地申请、审批、登记等环节。
   • 如果1996年办理的土地使用证是按照当时有效的法律法规和程序进行的，且土地来源合法、用途符合规划，那么该土地使用证就是合法的。
   • 反之，如果办理过程中存在违法违规行为，如未经审批擅自占用土地、土地来源不合法等，那么该土地使用证就可能面临被撤销或确认无效的风险。

3. 法律法规的适用性：

   • 需要注意的是，不同时期的法律法规对土地使用权的授予和管理可能有不同的规定。
   • 因此，在判断1996年办理的土地使用证是否合法时，需要依据当时有效的法律法规进行审查。
   • 如果当时的法律法规对土地使用权的授予和管理有明确规定，且土地使用证的办理符合这些规定，那么该土地使用证就是合法的。

4. 实际案例与司法实践：

   • 在实际案例中，法院通常会根据土地使用证的办理程序、土地来源、土地用途以及当时有效的法律法规等因素来综合判断土地使用证的合法性。
   • 如果土地使用证存在违法违规行为或不符合当时有效的法律法规规定，法院可能会判决撤销该土地使用证或确认其无效。

针对您的情况，我建议您：

• 首先，查阅1996年办理土地使用证时的相关法律法规和政策文件，了解当时对土地使用权授予和管理的具体规定。
• 其次，审查土地使用证的办理程序是否合法合规，包括土地申请、审批、登记等环节是否齐全、是否符合当时的规定。
• 最后，如果仍有疑问或担忧，您可以向当地土地管理部门或相关法律机构咨询，以获取更具体、更专业的法律意见。

如果您在房产领域还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，提供全面、专业的法律建议。