工厂如果非法招用未满16周岁的未成年人，将会面临一系列的法律后果和行政处罚。

首先，根据《中华人民共和国劳动法》第九十四条的规定，用人单位非法招用未满十六周岁的未成年人的，由劳动行政部门责令改正，并处以罚款。这意味着，一旦工厂被发现有此类违法行为，劳动行政部门会立即介入，要求工厂停止这种非法行为，并对其进行经济处罚。

其次，如果情节严重，市场监督管理部门还有权吊销工厂的营业执照。营业执照是工厂合法经营的重要凭证，一旦被吊销，工厂将无法继续正常运营，这对其来说是一个极其严重的后果。

在具体的执法过程中，劳动行政部门或市场监督管理部门会遵循一系列严格的程序。他们会先立案审查，决定是否对工厂进行调查。如果决定调查，会指定专人负责，及时组织调查取证，确保调查的公正性和准确性。在调查过程中，执法人员会出示执法证件，听取工厂的辩解陈述，并作详细记录。

调查结束后，相关部门会审查案件调查报告，对案件的违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度等方面进行全面审查，并提出处理意见。在作出行政处罚决定前，会制作《行政处罚通知书》送达工厂，告知其违法事实及其享有的陈述、申辩等权利。如果工厂符合听证规定，还会制作并送达《行政处罚听证告知书》。

最后，相关部门会制作行政处罚决定书，载明行政处罚告知、工厂陈述申辩或者听证情况等内容，并按法律规定的方式送达工厂。如果工厂逾期不申请复议、不提起行政诉讼，又不履行行政处罚决定，相关部门还会依法申请人民法院强制执行。

因此，工厂必须严格遵守相关法律法规，不得非法招用未满16周岁的未成年人。否则，将面临严重的法律后果和行政处罚。