结论：收了工程预付款但余款未付的情况下，一般不能直接拆除已完成的工程或相关设施，是否拆除需视具体情况和合同约定而定，且通常需通过法律途径解决。
分析说明：
合同约定优先：
- 在建设工程合同中，双方通常会就工程款的支付、工程的交付、违约责任等事项进行明确约定。如果合同中明确规定了在余款未付的情况下，发包方有权拆除或要求承包方拆除已完成的部分工程，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么发包方可能依据合同约定采取行动。但这种情况较为少见，因为拆除工程往往会造成双方更大的损失，且不符合工程建设的初衷。
- 更常见的情况是，合同中会约定在余款未付时，承包方有权暂停施工、要求支付余款及违约金、或者通过法律途径解决争议，而不是直接拆除工程。
法律原则与规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，合同双方应当遵循诚实信用原则，按照约定履行自己的义务。如果一方未按照约定支付工程款，另一方有权要求其支付，并可以要求赔偿因此造成的损失。
- 拆除工程并非法律规定的直接救济方式。在工程款纠纷中，承包方通常需要通过起诉、申请仲裁等法律途径来维护自己的权益，而不是直接拆除工程。拆除工程可能构成对发包方财产的侵害，需要承担相应的法律责任。
实际操作的考量：
- 拆除工程往往涉及复杂的法律关系和财产权益，需要谨慎处理。在实际操作中，拆除工程可能会引发更多的纠纷和损失，如损坏已完成的工程部分、影响周边环境和设施、造成人员伤亡等。
- 建议通过协商、调解、诉讼或仲裁等合法途径解决工程款纠纷。这些途径可以更有效地保护双方的合法权益，避免不必要的损失和风险。
特殊情况说明：
- 如果合同中确实存在特殊约定，允许在余款未付的情况下拆除工程，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么发包方在符合约定条件的情况下可能有权拆除。但这种情况需要严格审查合同条款和法律法规的适用性。
- 如果承包方存在严重违约行为，如工程质量不合格、未按期完成工程等，发包方可能根据合同约定或法律规定采取相应的救济措施，包括要求承包方拆除不合格部分或整个工程。但这与单纯的余款未付情况不同，需要具体分析违约情况和合同条款。
建议与行动：
- 对于发包方：如果承包方未按时支付余款，建议首先与承包方进行协商，寻求和解或达成新的支付协议。如果协商无果，可以考虑通过法律途径解决争议，如起诉或申请仲裁。
- 对于承包方：如果发包方未按时支付余款，同样建议首先与发包方进行协商。同时，可以准备好相关证据和材料，以便在必要时通过法律途径维护自己的权益。在任何情况下，都不应擅自拆除工程或采取其他过激行为。
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