结论前置：庭审中确认股权转让协议无效后，一般是可以去工商局进行变更登记的，但具体操作需依据实际情况并遵循相关法律法规及程序。

详细分析：

1. 股权转让协议无效的法律后果：

   • 当股权转让协议被法院确认为无效时，该协议自始不具有法律效力。这意味着，基于该协议所进行的股权变更登记在法律上应被视为未发生，即股权应恢复至转让前的状态。

2. 工商变更登记的依据：

   • 工商变更登记是股权转让完成后的一个重要法律程序，它标志着股权的正式转移。然而，当股权转让协议被确认无效时，这一程序的基础即不复存在。因此，从法律逻辑上讲，应允许进行反向的工商变更登记，以恢复股权的原始状态。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 提交法院判决书：在申请工商变更登记时，通常需要提交法院确认股权转让协议无效的判决书作为依据。这是证明股权变更登记应被撤销或更正的关键文件。
   • 遵循工商部门的规定：不同地区的工商部门可能对于股权变更登记的撤销或更正有不同的具体规定和流程。因此，在申请前，建议先咨询当地工商部门，了解具体的操作要求和所需材料。
   • 其他股东的意见：如果股权转让涉及其他股东，且其他股东对股权的恢复有异议，可能需要通过进一步的法律程序来解决争议。

4. 可能的法律障碍与解决方案：

   • 工商部门拒绝变更：如果工商部门以各种理由拒绝进行变更登记，可以考虑通过行政诉讼等法律途径来维护自己的权益。
   • 股权已进一步转让：如果在股权转让协议被确认无效前，股权已经再次被转让给第三方，且第三方为善意取得，那么情况将更为复杂。此时，可能需要通过协商、诉讼等多种方式来解决股权归属问题。

法律建议：

• 在庭审中确认股权转让协议无效后，应及时与工商部门沟通，了解变更登记的具体要求和流程。
• 准备好所有必要的法律文件，特别是法院的判决书，以证明股权变更登记应被撤销或更正。
• 如果遇到法律障碍或争议，建议及时咨询专业律师，以便得到更具体、更专业的法律建议和支持。

后续行动建议：

• 如果您已经获得了法院确认股权转让协议无效的判决书，并希望进行工商变更登记，建议尽快与当地工商部门联系，了解具体的操作步骤和所需材料。
• 如果在变更登记过程中遇到任何问题或争议，不要犹豫，及时向我咨询，我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议和支持。