针对您提出的“公交公司司机因事故停班，司机全责停班3个月应该怎么处理”的问题，这主要涉及到营运车辆停运损失的赔偿问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、停运损失的认定
维修时间确定：
- 首先，需要凭公交车辆的进出厂证明来确定维修时间。这是计算停运损失的基础。
营运属性证实：
- 公交车辆作为营运车辆，需要提供相关证件（如道路运输证、驾驶员证、行驶证等）来证实其营运属性。
损失金额核算：
- 停运损失的金额通常参照对应行业（如公共交通行业）的平均工资或收入标准来核算。具体到公交车辆，可能需要考虑每日的运营收入、成本等因素。
- 在您的案例中，虽然未直接给出公交行业的具体核算标准，但可以参考类似案例中的方法，即结合行业平均工资和车辆停运时间来计算。
二、赔偿责任的划分
司机全责：
- 既然司机被认定为全责，那么他应当承担因事故导致的停运损失的一部分或全部。但具体责任比例可能还需考虑公交公司的内部规定、保险合同条款等因素。
公交公司责任：
- 公交公司作为雇主，可能需要根据其与司机之间的劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规，来确定是否应承担部分或全部停运损失。
- 如果公交公司购买了相关保险（如车辆损失险、第三者责任险等），并且保险合同中涵盖了停运损失的赔偿，那么公交公司可以向保险公司索赔。
保险公司责任：
- 如果保险合同中明确约定了停运损失的赔偿条款，并且公交公司已按约定投保，那么保险公司应在保险范围内承担赔偿责任。
- 但需注意，保险合同中可能存在免赔率、免赔额等条款，这些将影响保险公司的实际赔偿金额。
三、处理建议
内部协商：
- 公交公司应首先与司机进行内部协商，明确双方的责任和赔偿比例。
保险索赔：
- 如果公交公司购买了相关保险，并且保险合同中涵盖了停运损失的赔偿，那么应及时向保险公司提出索赔申请。
法律途径：
- 如果内部协商和保险索赔均无法解决问题，公交公司可以考虑通过法律途径来维护自身权益。这可能包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。
四、注意事项
保留证据：
- 公交公司应妥善保留与事故相关的所有证据，包括事故认定书、维修进出厂证明、相关证件等，以便在需要时提供证明。
了解法律法规：
- 公交公司应了解并熟悉相关法律法规和保险合同条款，以便在处理停运损失赔偿问题时能够做出正确的决策。
综上所述，公交公司司机因事故停班且全责的情况下，停运损失的赔偿问题需要综合考虑多个因素。建议公交公司首先与司机进行内部协商，明确责任和赔偿比例；同时及时向保险公司提出索赔申请；如果问题无法解决，可以考虑通过法律途径来维护自身权益。