结论：持有残疾证的企业职工因病就医是否扣出勤奖，需根据企业规章制度、劳动合同以及相关法律法规综合判断，不能一概而论。以下从不同角度详细分析：

1. 企业规章制度与劳动合同的约定

• 核心依据：根据《劳动合同法》第四条，企业有权依法制定规章制度，但需经民主程序（如职工代表大会讨论）并公示或告知劳动者。若规章制度中明确规定“因病就医扣出勤奖”，且该制度合法有效（如不违反法律强制性规定、程序合法），则企业可能据此扣减。
• 例外情形：若劳动合同中明确约定“不因病假扣减出勤奖”，或企业规章制度未涉及此条款，则企业无权单方面扣减。
• 建议：职工可优先查阅劳动合同和企业规章制度，确认是否有相关条款。若制度违法或未公示，可主张条款无效。

2. 残疾职工的特殊保护

• 法律依据：根据《残疾人保障法》第三十八条，用人单位应提供适合残疾人的劳动条件和劳动保护，不得在晋职、晋级、评定职称、报酬、社会保险、生活福利等方面歧视残疾人。
• 法律解读：若企业仅因职工持有残疾证而对其因病就医扣出勤奖，可能涉嫌歧视，违反上述规定。但若扣减基于统一制度（如所有职工病假均扣出勤奖），则不构成歧视。
• 建议：残疾职工可主张企业不得因残疾身份对其区别对待，要求同等对待非残疾职工的病假待遇。

3. 病假工资与出勤奖的性质区分

• 病假工资：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，职工在医疗期内享有病假工资，标准不得低于当地最低工资的80%。病假工资是法定权益，企业必须支付。
• 出勤奖：出勤奖通常属于企业自主设立的福利性奖励，与出勤率挂钩。若职工因病缺勤，企业可能根据制度扣减出勤奖，但需确保制度合法且已公示。
• 关键点：病假工资与出勤奖是不同性质的待遇，企业不得以扣减出勤奖为由变相降低病假工资标准。

4. 地方性法规的补充规定

• 部分地区规定：如《上海市企业工资支付办法》第九条规定，职工病假期间，企业应按约定支付病假工资，且不得低于最低工资标准。对于出勤奖，若制度未明确约定，企业不得随意扣减。
• 建议：职工可查询所在地的工资支付规定，确认是否有额外保护条款。

综合建议

1. 核查依据：优先查阅劳动合同、企业规章制度及地方性法规，确认扣减出勤奖的合法性。
2. 协商沟通：与企业协商，明确扣减依据，要求提供书面制度依据。
3. 投诉维权：若企业违法扣减，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张补发工资及赔偿。
4. 残疾职工特别提醒：若认为因残疾身份被歧视，可同时依据《残疾人保障法》主张权益。

示例：若企业规章制度规定“病假超过3天扣出勤奖”，但未经过民主程序公示，且劳动合同未约定此条款，则职工可主张该制度无效，要求企业补发出勤奖。

如有进一步疑问或需具体操作指导，可直接向我咨询。