结论：上班途中发生交通意外，在起诉交通事故后，一般情况下是可以再申请工伤赔偿的，但医疗费用等部分项目不可兼得。下面我将从多个角度为您详细分析：
法律依据与赔偿原则
根据《中华人民共和国社会保险法》第四十二条及最高人民法院《关于审理工伤保险行政案件若干问题的规定》第八条，职工因第三人的原因（如上班途中遭遇车祸）受到伤害，即使已经获得第三人（如交通事故责任方）的民事赔偿，仍不影响其依法享受工伤保险待遇。这意味着，除医疗费用外，职工可以同时主张交通事故赔偿和工伤赔偿。两者基于不同的法律关系（侵权责任与工伤保险关系），并不冲突。
赔偿项目分析
兼得项目：
- 停工留薪期工资：这是职工因工伤需要暂停工作接受治疗期间，用人单位应支付的工资。
- 伤残津贴：对于因工伤导致伤残的职工，根据伤残等级，用人单位或工伤保险基金应支付的津贴。
- 一次性伤残补助金：职工因工伤导致伤残，根据伤残等级，一次性支付的补助金。
- 一次性工亡补助金（如适用）：对于因工死亡的职工，其直系亲属可以获得的一次性补助金。
- 住院伙食补助费、护理费、交通费、食宿费、康复治疗费等实际发生的费用：这些费用是职工因工伤治疗期间产生的实际支出，可以兼得。
不可兼得项目：
- 医疗费用：医疗费用遵循补偿原则，即不能因受伤而获得超出实际损失的利益。如果已在交通事故赔偿中获得医疗费用的全额赔付，则在工伤赔偿中不再重复支付。
申请条件与流程
要获得工伤赔偿，需满足以下条件并遵循相应流程：
工伤认定：
- 职工在上下班途中受到非本人主要责任的交通事故伤害，应认定为工伤。
- 用人单位应在事故发生后30日内向社会保险行政部门提出工伤认定申请；若用人单位未按时申请，工伤职工或其近亲属、工会组织可在事故伤害发生之日起1年内直接提出申请。
劳动能力鉴定：
- 认定为工伤后，还需进行劳动能力鉴定，以确定伤残等级。
- 根据伤残等级，职工可以主张相应的工伤赔偿。
实际操作建议
- 及时申请工伤认定：确保在事故发生后尽快进行工伤认定，以便后续申请工伤赔偿。
- 保留相关证据：包括交通事故责任认定书、医疗费用发票、工伤认定决定书等，以便在申请赔偿时提供证明。
- 了解赔偿项目：明确哪些项目可以兼得，哪些项目不可兼得，避免在申请赔偿时产生误解。
总结：上班途中发生交通意外后，您有权在起诉交通事故后，再申请工伤赔偿（医疗费用除外）。为确保自身权益，建议您及时进行工伤认定和劳动能力鉴定，并按照法定程序主张赔偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。