敬老院发放绩效补助是否合法，这主要取决于当地的政策规定以及敬老院的具体运营情况。从您提供的两份通知文件中，我们可以获取一些关键信息来解答这个问题。
首先，我们来看《全县乡镇敬老院运营补贴发放实施方案(试行)》这份文件。该方案明确指出了敬老院运营补贴的发放对象、条件、标准以及综合考评机制。其中，管理人员工资部分就包括了绩效工资的发放，如院长和副院长的绩效工资就是根据入住特困人员的人数和天数来核算的。这说明，在符合一定条件下，敬老院管理人员是可以获得绩效补助的，且这种补助是合法且受政策支持的。
再来看《关于拨付1-6月份养老机构集中照护服务绩效补助资金的通知》这份文件。它明确提到了为养老机构拨付集中照护服务绩效补助资金，这是根据《甘肃省民政厅甘肃省财政厅关于做好经济困难失能老年人集中照护服务工作的通知》的精神来执行的。这也进一步证明了，在特定政策框架下，敬老院或养老机构发放绩效补助是合法的。
综合以上两份文件，我们可以得出以下结论：
合法性依据：敬老院发放绩效补助的合法性主要来源于当地民政部门或相关政府部门的政策文件。只要敬老院符合政策规定的发放条件，就可以合法地获得并发放绩效补助。
发放条件：通常，敬老院需要完成备案手续、全年正常运营并未发生安全责任事故、符合相关规范和技术标准等条件，才能申领运营补贴或绩效补助。
发放标准：绩效补助的发放标准通常与敬老院的运营情况、入住老人数量、服务质量等因素有关。具体标准会因地区和政策的不同而有所差异。
监管机制：为了确保绩效补助的合法、合规使用，民政部门通常会建立综合考评机制，对敬老院的运营管理情况进行定期考评，并根据考评结果来核定补贴额度。
因此，敬老院在符合当地政策规定和发放条件的情况下，发放绩效补助是合法的。如果您对具体的政策规定或发放条件有疑问，建议您咨询当地民政部门或相关政府部门以获取更准确的信息。