结论：借款合同超过还款日期三年以后重新签订还款协议书，在一般情况下是受法律保护的，但具体是否受保护还需考虑诉讼时效是否中断、中止以及债务人在诉讼中是否提出时效抗辩等因素。

详细分析：

1. 诉讼时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。这意味着，如果借款合同约定的还款期限已过，且三年内债权人未采取法律行动，债务人可能获得诉讼时效抗辩权。

2. 重新签订还款协议书的影响：

   • 当借款合同超过还款日期三年后，双方重新签订还款协议书，这通常被视为债务人同意继续履行债务的意思表示。这种行为可以构成诉讼时效的中断，即从重新签订还款协议书之日起，诉讼时效期间重新计算三年。
   • 因此，只要重新签订的还款协议书是双方真实意思的表示，且内容合法有效，那么该协议书是受法律保护的。债权人可以依据新的还款协议书向债务人主张权利。

3. 诉讼时效中断、中止的特殊情况：

   • 诉讼时效中断：除了重新签订还款协议书外，如果债权人在原诉讼时效期间内向债务人主张了权利（如发送催款通知、提起诉讼等），且这一行为有明确的证据支持，那么诉讼时效会从中断时起重新计算三年。
   • 诉讼时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或其他法定障碍导致债权人无法行使请求权，诉讼时效会中止。在中止的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。这意味着，如果在此期间内出现了导致诉讼时效中止的法定事由，诉讼时效将相应延长。

4. 债务人自愿履行的情况：

   • 即使诉讼时效已经届满，如果债务人自愿履行债务，之后又以诉讼时效期间届满为由进行抗辩的，人民法院不予支持。这意味着，只要债务人愿意还钱，债权人仍然有受领并保有该款项的权利。

5. 实际诉讼中的考量：

   • 在实际诉讼中，即使超过了原定的诉讼时效期间，债权人仍然可以起诉，法院也会受理案件。但如果债务人以诉讼时效已过为由进行抗辩，并且债权人无法证明存在诉讼时效中断或中止的情形，那么债权人的诉求可能不会得到法院的支持。然而，如果债务人未提出时效抗辩，法院不会主动适用诉讼时效规定进行裁判，此时债权人仍有胜诉的可能。

建议：

• 对于债权人而言，在借款合同超过还款日期后，应尽快与债务人协商并重新签订还款协议书，以明确双方的权利义务关系，并构成诉讼时效的中断。
• 同时，债权人应尽可能保留相关证据（如催款通知、还款协议书、转账记录等），以证明自己在诉讼时效期间内采取了适当的行动来维护自己的权益。
• 如果债务人拒绝履行还款义务或提出诉讼时效抗辩，债权人应及时向法院提起诉讼，并寻求法律援助以维护自己的合法权益。

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