结论：公司支付的病假工资低于员工正常工资的80%，员工是可以申请劳动仲裁的。
法律背景与依据：
根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及《劳动法》的相关规定，员工在医疗期内，公司应当支付病假工资或疾病救济费，且病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。同时，如果劳动合同或集体合同中有明确约定病假工资的支付标准，且该标准不低于法定最低标准的，公司应按照约定支付。在多数情况下，这个约定标准往往会是员工正常工资的一定比例，如80%或更高。
具体分析：
如果劳动合同或公司规章制度中有明确约定：
- 若约定病假工资为员工正常工资的80%或更高，公司应按此约定支付。若公司支付的病假工资低于这个约定比例，员工有权要求公司补足差额，并可以通过劳动仲裁来维护自己的权益。
如果劳动合同或公司规章制度中没有明确约定：
- 根据法律规定，公司至少应支付员工病假工资不低于当地最低工资标准的80%。若公司支付的病假工资低于这个法定标准，员工同样有权申请劳动仲裁，要求公司按照法定标准支付病假工资。
申请劳动仲裁的流程与注意事项：
- 准备证据：员工需要准备能够证明自己与公司存在劳动关系、病假事实以及公司支付病假工资情况的证据，如劳动合同、工资条、病假证明等。
- 提交仲裁申请：员工应向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。
- 参与仲裁过程：在仲裁过程中，员工需要积极配合仲裁委员会的调查和调解工作，提供必要的陈述和证据。
- 执行仲裁结果：如果仲裁委员会作出有利于员工的裁决，公司应履行裁决义务。若公司不履行，员工可以向人民法院申请强制执行。
建议：
- 在申请劳动仲裁前，员工可以尝试与公司进行协商，看是否能够通过友好方式解决争议。
- 如果协商无果，员工应及时向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以免超过仲裁时效。
- 在整个过程中，员工应保留好所有相关证据，以便在需要时提供证明。
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