父亲仍然可以起诉女儿要求还款。以下从几个关键角度进行分析：
一、诉讼时效问题
未约定还款期限的借款合同诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条：“向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。”
- 在未约定还款期限的借款合同中，诉讼时效的起算点并非借款之日，而是当债权人要求债务人履行还款义务，且债务人拒绝履行时，诉讼时效才开始计算。因此，尽管借款已经12年，但如果父亲在此期间未曾向女儿明确要求还款，或者女儿未曾明确表示拒绝还款，则诉讼时效可能尚未开始计算，或者尚未超过最长保护期限20年。
母亲去世对诉讼时效的影响：
- 母亲的去世并不直接影响父亲对女儿的债权诉讼时效。诉讼时效是针对特定债权人与债务人之间的关系而言的，母亲去世后，其债权（如果存在且未转让或继承）可能由继承人继承，但父亲对女儿的债权是独立的，不受母亲去世的影响。
二、起诉条件与程序
起诉条件：
- 父亲作为原告，需要证明与女儿之间存在借款合同关系，且已经履行了出借义务（如转账记录、借条等）。
- 尽管未约定还款期限，但父亲可以主张女儿在合理期限内未还款，构成违约。
起诉程序：
- 父亲应向女儿户籍所在地或经常居住地的人民法院提起民事诉讼，提交起诉状及相关证据材料。
- 法院将审查案件材料，决定是否受理，并依法进行审理。
三、实际操作建议
收集证据：
- 父亲应尽可能收集与借款相关的证据，如转账记录、借条、聊天记录等，以证明借款事实的存在。
- 如果可能，尝试联系女儿的其他亲属或朋友，了解女儿的下落或联系方式，以便法院能够送达法律文书。
考虑法律援助或律师协助：
- 由于女儿失联，且案件可能涉及诉讼时效、证据收集等复杂问题，父亲可以考虑寻求法律援助或聘请专业律师协助处理。
关注案件进展：
- 在起诉后，父亲应密切关注案件进展，及时回应法院的询问或要求，确保案件能够顺利进行。
总结来看，尽管借款已经12年且女儿失联，但父亲仍然有权起诉女儿要求还款。关键在于证明借款事实的存在以及诉讼时效尚未超过。在实际操作中，父亲应收集相关证据，考虑寻求法律援助或律师协助，并密切关注案件进展。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。