当员工在公司工作六年后被裁员，赔偿的具体金额和方式确实会受到多种因素的影响，包括裁员的原因、公司的规章制度以及适用的劳动法律法规。以下是对这一问题的详细解答：

一、裁员原因与赔偿标准

1. 协商解除：

   • 如果公司与员工协商一致解除劳动合同，赔偿金额可以由双方自行约定。这通常会在协商过程中明确，可能包括经济补偿金、未休年假的工资报酬等。

2. 过失性裁员：

   • 如果员工因严重违反公司规章制度、失职或营私舞弊给公司造成重大损害等原因被裁员，公司一般不需要支付赔偿金。但公司必须提供充分的证据证明员工的过失行为。

3. 无过失性裁员：

   • 如果员工因不能胜任工作、患病或非因工负伤在规定的医疗期满后不能从事原工作等原因被裁员，公司应提前三十日以书面形式通知员工本人，或者额外支付一个月工资后，按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付经济补偿金。对于工作六年的员工，经济补偿金通常为六个月工资。
   • 若公司未提前通知而直接裁员，则除了上述经济补偿金外，还需额外支付一个月工资的代通知金。

4. 经济性裁员：

   • 在符合《劳动合同法》规定的经济性裁员情形下，公司也应按照无过失性裁员的标准支付经济补偿金。

5. 违法裁员：

   • 如果公司没有合法理由就裁员，属于违法解除劳动合同。此时，公司应按照经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。对于工作六年的员工，赔偿金通常为十二个月工资（即六个月工资的经济补偿金的两倍）。

二、计算赔偿金的基数

赔偿金的计算基数通常是员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。如果员工月工资高于公司所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

三、其他可能的赔偿或补偿

除了上述赔偿金外，员工还可能获得未休年假的工资报酬、加班费等其他补偿。这些补偿的具体金额应根据公司的规章制度和实际情况进行计算。例如，如果员工有未休的年假，公司应按照员工日工资收入的300%支付未休年假的工资报酬（其中包含公司已支付员工正常工作期间的工资收入）。

综上所述，当员工在公司工作六年后被裁员时，赔偿的具体金额和方式取决于裁员的原因、公司的规章制度以及适用的劳动法律法规。建议您在面临这种情况时，先与公司进行协商，了解具体的裁员原因和赔偿方案。如果协商无果，您可以咨询专业的劳动法律人士或向当地的劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，以维护自己的合法权益。