请病假时考勤是否会被扣款，这确实是一个涉及多方面因素的复杂问题，但核心在于用人单位的规章制度。下面我会详细为您分析：
首先，要明确的是，员工请病假是否会被扣考勤分或款项，主要取决于用人单位是否制定了相关规章制度，以及这些规章制度的具体内容和合法性。
如果规章制度未规定扣款：
- 在这种情况下，如果用人单位的规章制度中并没有明确提及请病假会进行考勤扣款，那么从制度层面来说，员工请病假时不应被扣款。员工只需按照公司规定的流程，如提前通知、提交病假证明等，履行正常的请假手续即可。
如果规章制度规定扣款但存在问题：
- 不合理情况：即便规章制度中有关于请病假考勤扣款的规定，但如果该规定明显不合理，比如对短时间的病假也进行大幅扣款，这样的规定可能会在实践中引发争议，并且可能不被法律支持。在这种情况下，员工有权与用人单位进行协商沟通，要求调整这些不合理的规定。
- 不合法情况：如果规章制度违反了法律法规的强制性规定，比如规定请病假直接扣除全勤奖且不支付病假工资，这样的规定是无效的。员工可以依法向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。
如果规章制度合理合法规定扣款：
- 如果用人单位的规章制度是经过民主程序制定的，内容合法合理，并且已经向员工进行了公示或告知，其中明确规定了请病假会进行适当的考勤扣款，那么在员工请病假时，用人单位按照该制度进行考勤扣款是具有一定合理性和合法性的。但需要注意的是，这种扣款不应影响员工依法享有的病假工资等权益。
员工应如何应对：
- 遵循公司规定：在请病假时，员工应首先了解并遵循所在公司的考勤管理制度和请假流程，确保自己的请假行为符合公司规定。
- 权益保护：如果员工认为自己在请病假过程中被不合理地扣款或受到其他形式的惩罚，应及时与公司的人力资源部门进行沟通协商。如果沟通无果，员工可以寻求法律援助或向相关部门投诉，以维护自己的合法权益。
综上所述，请病假时考勤是否会被扣款，主要取决于用人单位的规章制度。员工应充分了解并遵守公司规定，同时在权益受损时积极采取措施进行维护。希望这个解答能帮助您更好地理解这个问题。