核心结论：领导休假并不影响你申请离职的合法流程，但需注意离职申请的提交方式、离职期限及工作交接等关键环节，以确保离职过程合法合规且减少不必要的纠纷。以下从多个角度详细说明：

1. 离职申请的合法性
   根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日（试用期提前三日）以书面形式通知用人单位，即可解除劳动合同。领导是否休假不影响这一法定权利的行使，你只需确保离职申请以合法形式送达公司（如通过邮件、书面文件提交至人力资源部门或公司指定接收人）。若公司有内部离职流程（如填写离职申请表），按流程操作即可。

2. 离职申请的提交方式

   • 直接提交：若公司有明确的离职申请接收部门（如人力资源部），可直接将书面离职申请提交至该部门，并保留提交凭证（如签收记录、邮件截图）。
     
   • 间接提交：若领导休假期间公司无其他负责人接收，可通过公司内部系统（如OA）提交电子版离职申请，或联系其他上级或人力资源部门代为转交，并确认接收情况。
     
   • 紧急情况：若因个人原因需立即离职（如突发疾病、家庭变故等），可依据《劳动合同法》第三十八条，以“未及时支付劳动报酬”“未依法缴纳社保”等法定理由提出即时离职，但需提供相应证据。

3. 离职期限与工作交接

   • 法定期限：非试用期员工需提前30日通知，试用期员工提前3日通知。若公司同意缩短期限，可协商提前离职，但需以书面形式确认（如双方签署《离职协议》）。
     
   • 工作交接：即使领导休假，你仍需按公司要求完成工作交接（如整理文件、移交客户信息等）。若因领导休假导致交接困难，可书面说明情况并留存证据，避免公司以“未完成交接”为由扣发工资或拒绝出具离职证明。

4. 离职证明与工资结算

   • 离职证明：根据《劳动合同法》第五十条，公司应在解除劳动合同时出具离职证明。若领导休假导致延迟出具，可向人力资源部门或公司其他负责人主张权利，必要时可通过劳动监察部门投诉。
     
   • 工资结算：公司应在离职时一次性结清工资。若因领导休假导致延迟发放，可要求公司出具书面说明并明确支付时间，逾期未支付可依据《工资支付暂行规定》主张赔偿。

建议：

• 离职申请尽量采用书面形式，并保留提交凭证；
  
• 若公司以领导休假为由拖延办理离职手续，可明确告知其法律义务，并保留沟通记录；
  
• 如有争议（如公司拒开离职证明、扣发工资等），可向当地劳动仲裁委员会申请仲裁，维护自身合法权益。
  

如有进一步疑问（如离职补偿、竞业限制等），可直接向我咨询。