结论：公司从员工工资中扣除五险的费用，在符合法律规定的情况下是合法的。但具体扣除比例和方式需严格遵循相关法律法规。

分析说明：

1. 五险的缴纳义务：

   • 根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，职工应当参加基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险和生育保险，这五项保险通常被称为“五险”。其中，养老保险、医疗保险和失业保险由用人单位和职工共同缴纳，工伤保险和生育保险则完全由用人单位承担，职工个人不缴纳。

2. 工资中扣除五险的合法性：

   • 对于需要职工个人缴纳的部分（即养老保险、医疗保险和失业保险的个人部分），用人单位有权从职工工资中代扣代缴。这种扣除是合法的，但前提是用人单位必须按照法律规定的比例进行扣除，并且不得超过法律规定的上限。
   • 具体来说，养老保险的个人缴费比例通常为工资的8%，医疗保险的个人缴费比例根据地区不同而有所差异，但一般也在工资的2%左右，失业保险的个人缴费比例则相对较低。这些比例可能会根据地区的具体政策和调整而有所变化。

3. 扣除比例的合法性审查：

   • 用人单位在扣除五险费用时，必须确保扣除的比例符合当地社保政策的规定。如果用人单位擅自提高扣除比例或者以其他名义额外扣除费用，则可能构成违法行为，职工有权向相关部门投诉或寻求法律援助。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 用人单位在扣除五险费用时，应当向职工明确说明扣除的项目、比例和金额，并确保扣除的费用及时、足额地缴纳至社保机构。
   • 职工也有权查询自己的社保缴纳情况，如果发现用人单位存在未缴纳、少缴纳或者违规扣除的情况，可以向当地社保机构或者劳动监察部门投诉。

法律建议：

• 作为职工，如果你对用人单位从工资中扣除五险的费用有疑问或者发现存在违规行为，建议首先与用人单位进行沟通协商，要求其提供详细的扣除明细和社保缴纳证明。
• 如果沟通无果或者用人单位拒绝提供相关信息，你可以向当地社保机构或者劳动监察部门投诉，寻求官方部门的帮助和介入。
• 在整个过程中，保留好相关的证据材料（如工资条、社保缴纳记录等），以便在需要时提供证明。

特殊场景说明：

• 如果用人单位未按照法律规定为职工缴纳社保或者违规扣除费用，除了可能面临行政处罚外，还可能承担民事赔偿责任。职工有权要求用人单位补缴社保费用、支付经济补偿或者赔偿损失等。

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