结论：公司解除劳动合同的经济补偿金并非按照员工的平均实发工资计算，而是按照员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资（即应发工资，也称税前工资）来计算。
详细解释
计算基数：
- 经济补偿金的计算基数是员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。这一“平均工资”指的是员工的应发工资，它涵盖了员工在正常出勤情况下，按照劳动合同约定或法律规定应当获得的全部工资收入，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴、补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资等所有货币性收入。
应发工资与实发工资的区别：
- 应发工资是员工在正常出勤情况下，应获得的全部工资收入，即在扣除个人所得税、社会保险费、住房公积金等个人应缴纳部分之前的工资总额。
- 实发工资则是应发工资扣除这些费用后的实际到手工资。在计算经济补偿金时，应以应发工资为基准，而非实发工资。
特殊情况处理：
- 如果员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资低于当地最低工资标准的，经济补偿金将按照当地最低工资标准来计算。
- 如果员工工作不满十二个月，则按照其实际工作的月数来计算平均工资。
举例说明
假设员工小李每月的基本工资为6000元，绩效奖金平均每月1500元，餐补每月300元，且偶尔有加班工资。在计算经济补偿金时，应将这些所有货币性收入都纳入考虑范围。因此，小李的月应发工资（税前工资）可能是6000元（基本工资）+ 1500元（绩效奖金）+ 300元（餐补）+ 加班工资（如有）。如果公司在某个月与小李解除了劳动合同，并需要支付经济补偿金，那么计算基数就是小李在过去十二个月内的月平均工资（应发工资）。
法律建议
- 了解计算方式：员工在面临公司解除劳动合同时，应了解经济补偿金的计算方式，确保自己的合法权益得到充分保障。
- 保留相关证据：员工应保留好与工资收入相关的证据，如工资条、银行流水等，以便在需要时证明自己的应发工资水平。
- 咨询专业律师：如果员工对经济补偿金的计算有疑问或认为公司计算有误，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。
希望以上解释和建议能对你有所帮助。如果你还有其他关于劳动纠纷或法律顾问方面的问题，欢迎随时向我提问。