针对您描述的情况，若顶账房款已付清且发票已开，但对方不承认，您可以采取以下法律措施来维护自身权益：

1. 收集并固定证据：

   • 付款凭证：确保您保存了所有与付款相关的证据，如银行转账记录、收据、付款确认书等。这些证据能够直接证明您已经履行了付款义务。
   • 发票：发票是交易的重要凭证，它证明了双方之间存在交易关系，并且您已经支付了相应的款项。请确保发票的原件或复印件得到妥善保存。
   • 书面协议或合同：如果双方之间有签订书面协议或合同，请仔细审查其中的条款，特别是关于付款、交房及违约责任等方面的约定。这些条款将作为您主张权利的重要依据。
   • 沟通记录：保存与对方的所有沟通记录，包括短信、微信、邮件等。这些记录可能包含对方承认交易或付款的陈述，对证明您的主张非常有帮助。

2. 与对方协商：

   • 在采取法律行动之前，您可以尝试与对方进行协商，看是否能够通过友好方式解决争议。在协商过程中，您可以出示上述收集到的证据，以证明您的付款事实和对方的违约行为。

3. 发送律师函：

   • 如果协商无果，您可以考虑委托律师向对方发送律师函。律师函是一种正式的法律文件，它要求对方在规定的时间内履行其义务或回应您的主张。律师函的发送往往能够促使对方重新审视其立场，并可能推动争议的解决。

4. 提起诉讼：

   • 如果对方仍然拒绝承认交易或履行其义务，您可以向法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提交上述收集到的证据，以支持您的主张。法院将根据双方提供的证据和法律规定，作出公正的判决。
   • 诉讼请求：在诉讼中，您可以要求法院确认双方之间的交易关系，判决对方履行交房等义务，并可能要求对方承担违约责任，如支付违约金或赔偿损失等。

5. 申请强制执行：

   • 如果法院判决您胜诉，但对方仍然不履行判决义务，您可以向法院申请强制执行。法院将采取一系列措施，如查封、扣押、拍卖对方的财产等，以强制对方履行判决义务。

在处理此类争议时，请注意以下几点：

• 保持冷静和理性：避免与对方发生不必要的冲突或争执，以免加剧矛盾或影响证据的收集和保存。
• 及时咨询专业律师：虽然我已经为您提供了一些基本的法律建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在处理此类争议时，及时咨询专业律师是非常重要的。我可以根据您的具体情况，为您提供更详细、更具体的法律建议和指导。
• 遵守法律程序：在处理争议的过程中，请务必遵守法律程序和相关规定。不要采取非法手段或暴力行为来解决问题，以免给自己带来不必要的法律风险和麻烦。