购房协议部分内容用铅笔书写、部分用黑色圆珠笔书写且未按指纹，该协议是否生效需分情况讨论：

1. 协议内容完整性与真实性：

   • 购房协议的生效，首要条件是协议内容必须完整、真实，且双方意思表示一致。若铅笔书写部分与黑色圆珠笔书写部分共同构成了完整的购房协议，且双方均认可这些内容，那么书写工具的不同并不影响协议的效力。
   • 然而，若铅笔书写部分存在模糊、易擦除等特性，导致协议内容存在争议或不确定性，这可能会影响协议的证明力。在法律纠纷中，法院可能会更倾向于采纳不易篡改的证据，如黑色圆珠笔书写的内容。

2. 指纹按印的作用：

   • 指纹按印在法律上通常被视为对协议内容的确认和接受，具有强化协议证明力的作用。但并非所有协议都必须按指纹才能生效。
   • 若协议双方均已签字（无论是否按指纹），且签字真实有效，那么协议在双方之间即产生法律效力。指纹按印的缺失，并不直接导致协议无效。

3. 法律形式要求：

   • 根据《民法典》的相关规定，民事法律行为可以基于双方的意思表示一致而成立，并不一定要求特定的形式（如按指纹）。只要协议内容合法、双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，协议即具有法律效力。
   • 当然，对于某些特定类型的合同（如房屋买卖合同），法律可能规定了特定的形式要求（如必须书面形式、必须办理登记手续等）。但这些要求通常与书写工具或指纹按印无关。

4. 实际建议：

   • 为了确保购房协议的证明力和避免潜在的法律纠纷，建议双方在签订协议时使用不易篡改的书写工具（如黑色圆珠笔或钢笔），并尽量按指纹确认。
   • 若协议已经签订且存在上述情况（部分铅笔书写、未按指纹），但双方均认可协议内容且无争议，那么该协议仍然具有法律效力。但若发生纠纷，可能需要通过其他证据来辅助证明协议的真实性和内容。

总结来说，购房协议部分内容用铅笔书写、部分用黑色圆珠笔书写且未按指纹，并不直接导致协议无效。协议的效力主要取决于内容是否完整、真实，双方意思表示是否一致，以及是否符合法律、行政法规的强制性规定。若您在购房过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。