夫妻双方手写的协议书按指纹后，在符合法律规定的情况下是有效的。以下从多个角度为您详细分析：

一、协议书有效的法律基础

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为有效需满足以下条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力：夫妻双方作为协议书的签订主体，必须具备完全民事行为能力，即能够独立进行民事活动，承担民事责任。
2. 意思表示真实：协议书的内容必须是夫妻双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：协议书的内容必须合法，不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背社会公德和伦理道德。

二、手写协议书按指纹的效力

1. 手写协议书的效力：手写协议书本身并不影响其法律效力，只要满足上述民事法律行为有效的条件，手写协议书同样具有法律效力。
2. 按指纹的效力：按指纹在法律上通常被视为一种身份确认的方式，类似于签名。在协议书上按指纹，可以视为夫妻双方对协议内容的确认和接受，进一步增强了协议书的证明力。但需要注意的是，按指纹并不是协议书生效的必要条件，只要协议书内容合法、双方意思表示真实，即使没有按指纹，协议书也可能具有法律效力。

三、协议书生效的特殊情形

1. 涉及特定财产或权益的协议：如果协议书涉及夫妻共同财产的分割、子女抚养权的归属等特定财产或权益，除了满足上述一般条件外，还可能需要符合特定的法律要求或程序。例如，涉及不动产分割的协议，可能需要办理过户登记手续才能产生法律效力。
2. 协议书的公证：虽然公证不是协议书生效的必要条件，但经过公证的协议书在证据效力上通常更强。如果夫妻双方对协议书的真实性、合法性有较高要求，可以考虑进行公证。

四、建议与注意事项

1. 确保协议书内容合法、明确：在签订协议书前，夫妻双方应充分了解相关法律法规，确保协议书内容合法、明确，避免出现模糊不清或违反法律规定的条款。
2. 保留相关证据：在签订协议书时，建议夫妻双方保留好相关证据，如签订时的照片、视频等，以备不时之需。
3. 咨询专业律师：如果夫妻双方对协议书的法律效力或内容存在疑问，建议咨询专业律师，以确保协议书的合法性和有效性。

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