针对您提出的“离职后员工二次入职，再约定试用期时赔偿金怎么算”的问题，这确实是一个涉及法律和企业制度的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律基础与原则
首先，我们需要明确的是，根据《劳动合同法》的规定，同一用人单位与劳动者只能约定一次试用期。这是法律的基本原则，旨在保护劳动者的权益，避免用人单位通过重复约定试用期来规避法律义务或损害劳动者利益。
然而，也存在例外情况。如果员工离职后重新签订劳动合同，并且岗位或工作内容发生了“实质性变化”，那么用人单位是可以与员工重新约定试用期的。这里的“实质性变化”通常指的是岗位层级调整、工作职责差异显著等，且需要企业提供书面说明并留存证据，如岗位说明书的对比等。
二、赔偿金的计算
违法约定试用期的后果：
- 如果用人单位违反法律规定，重复约定试用期，那么将面临支付赔偿金的法律责任。
- 赔偿金的计算方式通常是：已履行的违法试用期期间，用人单位需要按照该员工试用期满月工资的标准，支付双倍的差额作为赔偿。
- 同时，用人单位还需要补足员工在违法试用期期间的工资差额，确保员工的实际收入不低于法定标准。
合法约定试用期的情形：
- 如果员工二次入职时，岗位或工作内容确实发生了实质性变化，且用人单位依法与员工重新约定了试用期，那么在这种情况下，是不存在赔偿金问题的。
- 用人单位只需确保试用期的约定符合法律规定，即试用期长度不超过法定上限，并且明确告知员工试用期的考核标准及转正流程。
三、实操建议与风险提示
合同文本规范：
- 在劳动合同中明确注明：“因岗位调整/工作内容变更，经双方协商一致同意设定试用期”。这样可以避免后续因试用期约定而产生的争议。
证据留存：
- 用人单位应保存好岗位说明书、薪资结构表、工作交接记录等文件，以证明员工二次入职时岗位或工作内容确实发生了实质性变化。
沟通机制：
- 在试用期前与员工进行面谈，明确考核标准及转正流程。这不仅可以减少后续争议，还可以提高员工的工作积极性和满意度。
风险提示：
- 用人单位应谨慎操作二次入职的试用期约定，避免违法约定试用期而面临支付赔偿金的风险。
- 可以通过典型案例参考来了解违法约定试用期的后果，如某公司因未证明岗位变化而重复约定试用期，被判决赔偿员工5万元。
总结
离职后员工二次入职再约定试用期时，赔偿金的计算取决于用人单位是否违法约定了试用期。如果用人单位违反法律规定重复约定试用期，那么将面临支付赔偿金的法律责任。因此，用人单位应严格遵守法律规定，谨慎操作二次入职的试用期约定，并通过制度优化和合规管理来平衡用工灵活性与法律风险。