企业假期规定违法时，通常由劳动行政部门负责处罚。以下是对这一问题的详细分析：

一、处罚主体

根据《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规，当企业的假期规定违反法律规定时，劳动行政部门（如人力资源和社会保障局）是负责进行处罚的机关。劳动行政部门有权对企业的违法行为进行调查、取证，并依据相关法律法规作出相应的处罚决定。

二、处罚依据

劳动行政部门在处罚企业时，会依据以下法律法规：

1. 《中华人民共和国劳动法》：该法规定了劳动者享有休息休假的权利，以及企业应遵守的假期制度。如果企业的假期规定违反了该法的规定，劳动行政部门有权进行处罚。
2. 《中华人民共和国劳动合同法》：该法进一步明确了劳动合同中应包含的条款，包括工作时间、休息休假等。如果企业的假期规定与劳动合同中的约定不符，且违反了法律法规，同样会受到处罚。
3. 其他相关法规：如《职工带薪年休假条例》、《企业职工带薪年休假实施办法》等，这些法规对企业的假期制度进行了具体规定，劳动行政部门在处罚时会参考这些法规。

三、处罚措施

劳动行政部门在发现企业假期规定违法时，可能会采取以下处罚措施：

1. 责令改正：要求企业立即停止违法行为，并按照法律法规的规定重新制定假期制度。
2. 罚款：根据违法行为的严重程度和企业的规模等因素，对企业处以一定数额的罚款。
3. 其他行政处罚：如警告、通报批评等，具体取决于违法行为的性质和后果。

四、企业应对建议

为了避免因假期规定违法而受到处罚，企业应采取以下措施：

1. 了解法律法规：企业应充分了解并遵守《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规中关于假期制度的规定。
2. 制定合法合规的假期制度：企业应根据法律法规的要求，结合自身的实际情况，制定合法合规的假期制度，并确保该制度在劳动合同中得到体现。
3. 加强内部管理：企业应加强对假期制度的管理和监督，确保员工能够按照制度享受假期，并及时处理员工关于假期的投诉和纠纷。

五、员工权益保护

如果员工发现企业的假期规定违法，可以向劳动行政部门投诉或举报。劳动行政部门在接到投诉或举报后，会进行调查并依法处理。同时，员工也可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

如有任何关于公司法务或劳动工伤方面的疑问，欢迎直接向我咨询。