结论：国道旁的房子原先三层，现在想在上面加一楼是否合法，这主要取决于是否满足相关规划、建设等法律法规的要求，以及是否取得了必要的审批手续。若未取得合法审批手续，则加建行为属于违法建设。以下从多个角度进行详细分析：

一、规划许可角度

1. 规划要求：根据《城乡规划法》等相关法律法规，任何建设活动都应当符合城乡规划的要求。国道旁的房子加建楼层，属于建设活动的范畴，因此必须首先确认该加建行为是否符合当地的城乡规划。

2. 审批手续：若加建行为符合规划要求，接下来需要办理的是建设工程规划许可证。这是进行建设活动的法定凭证，未经许可擅自进行建设，将面临法律责任。因此，在加建前，必须向当地城乡规划主管部门申请并获得建设工程规划许可证。

二、建设许可角度

1. 施工许可：除了规划许可外，加建行为还需要获得施工许可。根据《建筑法》等相关法律法规，进行建筑工程施工前，建设单位应当向工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门申请领取施工许可证。未经许可擅自施工，同样将面临法律责任。

2. 施工安全与质量：在获得施工许可后，加建行为还必须遵守施工安全与质量的相关规定。这包括确保施工过程中的安全措施到位、使用符合标准的建筑材料等。若因加建行为导致安全事故或质量问题，建设单位将承担相应的法律责任。

三、相邻权角度

1. 相邻关系：加建行为还可能涉及到相邻权的问题。根据《民法典》中关于相邻关系的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。因此，在加建前，应充分考虑对周边邻居的影响，如采光、通风、隐私等，并尽量协商解决可能产生的纠纷。

2. 法律责任：若加建行为对周边邻居造成了损害，如遮挡采光、影响通风等，建设单位可能需要承担相应的法律责任，包括赔偿损失、恢复原状等。

四、实际操作建议

1. 咨询当地规划部门：在决定加建前，建议先咨询当地城乡规划主管部门，了解加建行为是否符合规划要求，以及需要办理哪些审批手续。

2. 办理相关手续：若加建行为符合规划要求，应按照规定办理建设工程规划许可证和施工许可证等相关手续。

3. 确保施工安全与质量：在施工过程中，应严格遵守施工安全与质量的相关规定，确保施工过程中的安全措施到位、使用符合标准的建筑材料等。

4. 协商解决相邻关系问题：在加建前，应与周边邻居进行充分沟通，尽量协商解决可能产生的纠纷，避免因此引发法律纠纷。

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