结论：没有填写加班申请并不必然导致无法获得加班费，关键在于能否证明加班事实的存在。以下从不同角度进行分析：
加班申请与加班费的关系
- 加班申请的作用：加班申请通常是公司内部管理流程的一部分，用于记录员工的加班情况，以便公司进行考勤管理和工资核算。然而，它并非法律规定的获得加班费的必要条件。
- 加班费的法律依据：根据《劳动法》及相关规定，员工在超出正常工作时间工作的情况下，有权获得加班费。这一权利的获得，并不完全依赖于是否填写了加班申请。
如何证明加班事实
- 其他证据形式：即使没有填写加班申请，员工仍可以通过其他方式证明加班事实，如考勤记录、工作邮件、工作记录、同事证言等。这些证据可以形成完整的证据链，证明员工确实在超出正常工作时间工作。
- 公司规章制度：如果公司规章制度中明确规定了加班申请是获得加班费的必要条件，但这一规定违反了法律法规的强制性规定（如《劳动法》中关于加班费支付的规定），则该规定无效。员工仍有权依据法律法规要求公司支付加班费。
公司拒付加班费的应对措施
- 与公司协商：首先，员工可以尝试与公司进行协商，说明加班事实及应获得加班费的法律依据，争取公司主动支付加班费。
- 申请劳动仲裁：如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司支付加班费。在仲裁过程中，员工需要提供充分的证据证明加班事实的存在。
- 提起诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，员工还可以向法院提起诉讼，通过司法途径维护自己的合法权益。
法律建议
- 保留证据：员工在日常工作中应注意保留与加班相关的证据，如考勤记录、工作邮件等，以便在需要时证明加班事实。
- 了解公司规章制度：员工应了解公司的规章制度，特别是关于加班和加班费支付的规定。如果发现公司规章制度违反法律法规，应及时向相关部门反映或寻求法律帮助。
- 及时维权：如果公司拒付加班费，员工应及时采取措施维权，避免超过法定时效期间而丧失胜诉权。
举例说明：假设某员工在周末加班，但未填写加班申请。然而，该员工有考勤记录显示其在周末加班，同时还有工作邮件证明其在加班期间处理了工作事务。在这种情况下，该员工完全有权要求公司支付加班费，并可以通过劳动仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
后续行动建议：如果您遇到了类似情况，建议首先与公司进行沟通协商，同时收集并保留好相关证据。如果协商无果，可以考虑申请劳动仲裁或提起诉讼。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。