房屋拆迁协议的签订主体主要取决于房屋所在土地的性质以及拆迁的具体情况，以下是详细分析：
国有土地上房屋征收：
- 房屋征收部门：根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》，市、县级人民政府确定的房屋征收部门负责组织实施本行政区域的房屋征收与补偿工作。因此，在国有土地上房屋征收中，被征收人（即被拆迁人）通常应与这些房屋征收部门签订拆迁补偿协议。协议内容会明确补偿方式、补偿金额、安置用房面积、搬迁期限等关键条款。
- 被征收人：被征收人是指被征收房屋的所有权人，即房屋产权证书上登记的所有者。若房屋存在共有情况（如夫妻共有、多个继承人共有），则所有共有人都应参与协议的签订，或出具授权委托书委托其中一人代表全体共有人签字。
集体土地征收涉及农村房屋拆迁：
- 集体经济组织或村民委员会：在集体土地征收涉及农村房屋拆迁的情况下，由于集体土地归农村集体经济组织成员集体所有，因此一般由农村集体经济组织或者村民委员会作为代表与被拆迁人签订拆迁补偿协议。这一过程中，村委会需经过村民大会讨论等法定程序，确保拆迁工作的合法性和公正性。
特殊情形下的签字主体：
- 委托代理人：当房屋所有权人因特殊原因（如重病、出国等）无法亲自签字时，可根据相关法律规定委托代理人代为签字。代理签字时需提供经公证的授权委托书，明确代理人的权限和责任，以确保代理行为的合法性。
- 法定监护人：对于无民事行为能力人或限制民事行为能力人的房屋，由其法定监护人代签。法定监护人在代签时应严格保障被监护人的合法权益，不得损害其利益。
在签订房屋拆迁协议时，被拆迁人应注意以下事项：
- 审查拆迁人主体资格：在签订拆迁协议前，被拆迁人应仔细审查拆迁人的主体资格和相关的法律文件，确保其具有合法的拆迁权力和权限。这是保障自己合法权益不受侵害的第一步。
- 仔细阅读协议内容：被拆迁人在签订协议前，务必仔细阅读协议内容，特别是补偿方式、补偿标准、安置方式等关键条款。如有任何疑问或不明确的地方，应及时向我咨询进行解答和确认。
- 保障自身权益：在签订拆迁协议时，被拆迁人应确保自己的权益得到充分保障。如认为补偿标准不合理或安置方式不满意，有权与拆迁方进行协商，并寻求法律支持以维护自身权益。
举例说明：
假设某城市进行旧城改造，涉及国有土地上的房屋征收。在此情况下，被征收人应与市、县级人民政府确定的房屋征收部门签订拆迁补偿协议。若被征收房屋为夫妻共有财产，则夫妻双方均需在协议上签字，或出具授权委托书委托其中一人签字。
再如，某农村地区因建设需要征收集体土地上的房屋。在此情况下，一般由农村集体经济组织或者村民委员会作为代表与被拆迁人签订拆迁补偿协议。若被拆迁人为无民事行为能力人，则由其法定监护人代签协议。
总结与建议：
房屋拆迁协议的签订是一项复杂而重要的法律行为。被拆迁人在此过程中应保持警惕，仔细审查拆迁人的主体资格和协议内容，确保自己的合法权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。