结论：停工留薪期未满时劳动关系协商解除的，是否需要继续支付停工留薪期工资，需根据解除劳动关系的具体原因及情况来判断。
详细分析：
用人单位违法解除劳动关系：
- 在停工留薪期内，用人单位不得随意解除劳动关系。若用人单位违反法律规定，在停工留薪期内违法解除与劳动者的劳动关系，那么用人单位不仅需要承担违法解除劳动合同的赔偿责任，还需支付劳动者停工留薪期内剩余时间的工资。这是因为停工留薪期是劳动者因工伤或职业病而暂停工作接受医疗的期间，用人单位有义务保障劳动者的这一权益。
劳动者主动解除劳动关系：
- 若劳动者在停工留薪期内主动提出解除劳动关系，用人单位仍需支付从工伤发生之日起至解除之日应享有的停工留薪期工资。这是因为劳动者在停工留薪期内虽然未实际工作，但其因工伤或职业病而暂停工作，用人单位有义务按照法律规定支付其停工留薪期的工资。
双方协商一致解除劳动关系：
- 如果双方是在协商一致的基础上解除劳动关系的，那么是否需要支付停工留薪期工资，则取决于双方协商的结果。如果协商中明确约定了用人单位需支付停工留薪期工资至一定期限或全额支付，那么用人单位应按照约定履行。如果协商中未提及或约定不明确，则可能需要根据相关法律法规及实际情况进行判断。
特殊情况说明：
- 在处理此类问题时，还需综合考虑劳动合同、公司规章制度及相关法律法规的具体规定。特别是当解除劳动关系涉及经济补偿、工伤赔偿等其他权益时，应仔细审查各种情况，确保劳动者权益得到妥善保护。例如，如果劳动者在停工留薪期内因工伤导致残疾或死亡，那么用人单位可能还需要承担相应的工伤赔偿责任。
建议：
- 对于劳动者而言，在停工留薪期内应谨慎考虑解除劳动关系的问题。如果确实需要解除，应与用人单位充分协商，并明确约定停工留薪期工资的支付问题。同时，劳动者也应了解自己的合法权益，必要时可寻求法律援助或咨询专业律师。
- 对于用人单位而言，应严格遵守相关法律法规，保障劳动者的合法权益。在停工留薪期内不得随意解除劳动关系，如需解除应与劳动者充分协商并达成一致意见。同时，用人单位也应建立健全的规章制度，明确停工留薪期工资的支付标准和方式等。
总之，停工留薪期未满时劳动关系协商解除的，是否需要继续支付停工留薪期工资需根据具体情况判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。