结论：公司报税时申报的工资数额与实际发放工资不符，是否合法需分情况讨论。若公司申报的工资数额低于实际发放工资，一般不违法，但可能影响员工权益；若公司申报的工资数额高于实际发放工资，则可能涉嫌偷税漏税，是违法的。

分析说明：

1. 公司申报工资低于实际发放工资：

   • 不违法性：从税务申报的角度来看，公司申报的工资数额是其向税务机关报告的应税工资基数，这个基数并不一定要与实际发放给员工的工资完全一致（当然，通常应该是相符的）。如果公司出于某种原因（如避免过高税负、内部财务管理等）申报的工资数额低于实际发放工资，且这种申报并未导致公司少缴税款（即公司已按照实际发放的工资计算并缴纳了相应的税款），那么这种行为本身并不直接构成违法。
   • 潜在影响：然而，这种不一致可能对员工产生不利影响。例如，在计算社保、公积金等福利待遇时，通常是以申报的工资数额为基础。如果申报工资低于实际工资，员工可能无法享受到应有的福利待遇。此外，在发生劳动纠纷时，申报工资也可能成为确定赔偿标准的重要依据。

2. 公司申报工资高于实际发放工资：

   • 违法性：如果公司申报的工资数额高于实际发放给员工的工资，且这种申报导致公司少缴了税款，那么这种行为就涉嫌偷税漏税，是违法的。税务机关有权对公司进行税务稽查，并要求公司补缴税款、滞纳金及罚款。
   • 法律后果：根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，偷税漏税行为可能面临严重的法律后果，包括但不限于补缴税款、滞纳金、罚款，甚至可能涉及刑事责任。

特殊场景：

• 在某些特定情况下，如公司为了享受某些税收优惠政策或符合特定行业规定而调整申报工资数额，且这种调整是合法合规的，那么这种行为就不构成违法。但这种情况较为特殊，且需要满足严格的条件。

行动建议：

• 对于员工：如果发现公司申报的工资数额与实际发放工资不符，且这种不符可能影响自己的权益（如社保、公积金等福利待遇），建议与公司沟通协商，要求公司按照实际工资数额进行申报。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门或税务机关投诉举报。
• 对于公司：应确保申报的工资数额与实际发放工资相符，避免涉嫌偷税漏税等违法行为。同时，公司也应加强内部财务管理和税务合规意识，确保各项税务申报工作的准确性和合法性。

法律依据：

• 《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条：纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或者在帐簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。对纳税人偷税的，由税务机关追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。