结论：公司取消只发放了3个月的额外补贴是否合法，需根据补贴的性质、发放条件以及双方约定或公司规章制度来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 补贴性质与发放条件：

   • 若额外补贴属于工资的一部分（如绩效奖金、岗位津贴等），且双方劳动合同或公司规章制度中明确规定了发放条件、期限或标准，公司单方面取消可能构成违约或违法。例如，若补贴是作为对员工特定工作表现的奖励，且公司承诺持续发放一定期限，则取消可能违反约定。
   • 若补贴属于临时性、一次性奖励，或公司明确说明补贴的发放与特定项目、任务完成情况挂钩，且该项目或任务已结束，公司取消补贴则可能合法。

2. 双方约定与规章制度：

   • 审查劳动合同、员工手册或公司相关规章制度中是否有关补贴发放的条款。若存在明确约定，公司需按约定执行；若无约定或约定不明，则需结合行业惯例、公平原则等综合判断。
   • 若公司规章制度中规定了补贴的发放条件及取消情形，且该制度已依法告知员工（如通过公示、培训等方式），公司取消补贴可能合法。但需注意，规章制度不得违反法律法规的强制性规定，如不得低于最低工资标准等。

3. 法律程序与民主程序：

   • 若公司规章制度涉及员工切身利益（如工资、福利等），需经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论、协商确定），并公示或告知员工。未经民主程序制定的规章制度，对员工不具有约束力，公司据此取消补贴可能违法。
   • 公司取消补贴前，应与员工进行充分沟通，说明取消原因及依据，避免引发劳动争议。

4. 可能的法律后果：

   • 若公司取消补贴违法，员工有权要求公司继续履行约定或支付拖欠的补贴，并可能要求公司支付经济补偿金（如因取消补贴导致员工离职）。
   • 若公司取消补贴合法，但员工认为公司行为存在欺诈、胁迫等情形，员工可依法维护自身权益，但需承担举证责任。

建议：

• 员工应首先审查劳动合同、公司规章制度等文件，了解补贴的性质、发放条件及取消情形。
• 若认为公司取消补贴违法，可与公司协商解决；协商不成，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 公司应依法制定规章制度，明确补贴的发放条件及取消情形，并在取消补贴前与员工进行充分沟通，避免引发劳动争议。

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